Phylogeny of Flabellulidae (Amoebozoa: Leptomyxida) inferred from SSU rDNA sequences of the type strain of Flabellula citata Schaeffer, 1926 and newly isolated strains of marine amoebae

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F08%3A00318048" target="_blank" >RIV/60077344:_____/08:00318048 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12310/08:00009768

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Phylogeny of Flabellulidae (Amoebozoa: Leptomyxida) inferred from SSU rDNA sequences of the type strain of Flabellula citata Schaeffer, 1926 and newly isolated strains of marine amoebae

Original language description

New strains of non-vannellid flattened amoebae isolated from fish, an invertebrate and marine environment were studied together with Flabellula citata Schaeffer, 1926 selected by morphology as a reference strain. The study revealed a paucity of featuresdiscriminating individual strains at the generic level, but mutual phylogenetic relationships within the assemblage of strains as well as their affiliation to Leptomyxida were clearly evidenced. The SSU rDNA dataset of leptomyxids was expanded and new branching pattern was identified within this lineage of Amoebozoa. Sequences of three newly introduced strains clustered in close relationship with the type strain of F. citata, the type species of the genus. Three strains including one resmbling Flamellasp. were positioned within the sister-group containing Paraflabellula spp. Results of phylogenetic analysis confirmed doubts of previous authors regarding generic identification of ATCC strains of Rhizamoeba spp.

Czech name

Fylogeneze čeledi Flabellulidae (Amoebozoa: Leptomyxida) odvozená z SSU rDNA sekvencí typového kmene Flabellula citata Schaeffer, 1926 a nově izolovaných kmenů mořských améb

Czech description

Nové kmeny plochých améb izolované z ryb, bezobratlých živočichů a mořského prostředí byly studovány společně s referenčním kmenem Flabellula citata Schaeffer, 1926. Výsledky upozornily na nedostatek znaků rozlišujících jednotlivé kmeny na úrovni rodů. Studie jasně odhalila vzájemné fylogenetické vztahy kmenů studovaného souboru i jejich začlenění do řádu Leptomyxida, rozšířila dataset SSU rDNA sekvencí reprezentantů řádu Leptomyxida a představila nový model větvení ve skupině Amoebozoa. Sekvence tří nově zahrnutých kmenů se seskupily v těsné blízkosti typového kmene F. citata. Tři kmeny, včetně jednoho podobajícího se Flamella sp., se umístily v sesterské skupině zahrnující Paraflabellula spp. Výsledky fylogenetické studie potvrdily pochybnosti předchozích autorů ohledně rodového zařazení některých kmenů Rhizamoeba a Ripidomyxa.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LC522" target="_blank" >LC522: ICHTHYOPASITOLOGY RESEARCH CENTRE</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Folia Parasitologica

ISSN

0015-5683

e-ISSN

—

Volume of the periodical

55

Issue of the periodical within the volume

4

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

9

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000262527700002

EID of the result in the Scopus database

—