Phylogeny of Neoparamoeba strains isolated from marine fish and invertebrates as inferred from SSU rDNA sequences

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F07%3A00089487" target="_blank" >RIV/60077344:_____/07:00089487 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12310/07:00008834

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Phylogeny of Neoparamoeba strains isolated from marine fish and invertebrates as inferred from SSU rDNA sequences

Original language description

Characterisation of 9 strains selected from primary isolates referable to Paramoeba/Neoparamoeba spp. is reported. Based on ultrastructural study, 5 strains isolated from fish (AGD affected Atlantic salmon and dead Southern bluefin tuna), one from net material of sea-cage 3 strains from invertebrates (sea urchins and crab) were assigned to the genus Neoparamoeba Page, 1987. Phylogenetic analyses based on SSU rDNA sequences revealed that 3 strains from the invertebrates and two out of three strains fromgills of Southern bluefin tunas became members of the N. branchiphila clade, while fish-isolated strains and environmental strains, clustered within the clade of N. pemaquidensis. These and previously reported results point to the possibility that N. pemaquidensis and N. branchiphila can affect both, fish and invertebrates. A new potential fish host, Southern bluefin tuna, was included in the list of farmed fish endangered by the latter amoeba species.

Czech name

Kmeny rodu Neoparamoeba izolované z mořských ryb a bezobratlých a jejich fylogeneze odvozená ze sekvencí SSU rDNA

Czech description

Z primárních izolátů mořských améb zařazených do rodů Paramoeba/Neoparamoeba bylo charakterizováno 9 kmenů. Pět kmenů izolovaných z ryb (z lososů s amébovým onemocněním žaber a z uhynulých tuňáků), 1 kmen ze sítí plovoucích klecí a 3 z bezobratlých (mořských ježků a kraba) byly zařazeny do rodu Neoparamoeba. Fylogenetické analýzy založené na sekvencích SSU rDNA zařadily 3 kmeny z bezobratlých a 2 z žaber tuňáků ke kmenům druhu N. branchiphila zatímco zbývající kmeny izolované z ryb a environmentální kmen se zařadily k N. pemaquidensis. Práce ukázala, ze N. branchiphila i N. pemaquidensis mohou infikovat ryby i bezobratlé. Do seznamu ryb ohrožených amébovým onemocněním žaber byl zařazen i tuňák.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EA - Morphology and cytology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Diseases of Aquatic Organisms

ISSN

0177-5103

e-ISSN

—

Volume of the periodical

74

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

9

Pages from-to

57-65

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—