Neoparamoeba branchiphila n. sp., and related species of the genus Neoparamoeba Page, 1987: morphological and molecular characterisation of selected strains

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077409%3A_____%2F05%3A00023698" target="_blank" >RIV/60077409:_____/05:00023698 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12310/05:00006370

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Neoparamoeba branchiphila n. sp., and related species of the genus Neoparamoeba Page, 1987: morphological and molecular characterisation of selected strains

Original language description

A total of 18 Neoparamoeba strains were characterised both morphologically and using the SSU rRNA gene sequences as molecular markers. Nine were isolated from gills of farmed Atlantic salmon, Salmo salar L., six from sediments sampled in areas of sea-cage farms and three from net material of sea-cages. The newly obtained sequences extended substantially the dataset of Neoparamoeba strains available for phylogenetic analyses, which were used to infer taxonomic relatedness among 32 strains morphologicallyassigned to this genus. In addition to the N. pemaquidensis and N. aestuarina clades, phylogenetic analyses clearly distinguished a third clade with sequences from six strains. Members of this clade are characterised as representatives of a new speciesN. branchiphila n. sp. The diagnostic primers for the identification of this species are introduced.

Czech name

Neoparamoeba branchiphila n. sp. a příbuzné druhy rodu Neoparamoeba Page, 1987: morfologická a molekulární charakterizace vybraných kmenů

Czech description

Osmnáct kmenů rodu Neoparamoeba bylo charakterizováno morfologicky a pomocí sekvencí SSU rRNA genu. Devět bylo izolováno z žaber lososů Salmo salar z intenzivních chovů, šest ze sedimentů odebraných v zóně chovných klecí a tři z materiálu na sítích plovoucích klecí. Nově získané sekvence, které podstatně obohatily data použitelná pro fylogenetické analýzy, byly využity k odvození taxonomických vztahů mezi 32 kmeny morfologicky řazenými do rodu Neoparamoeba. Kromě kladusů N. pemaquidensis a N. aestuarinaodhalila fylogenetická analýza ještě třetí kladus tvořený sekvencemi šesti kmenů. Ty reprezentují nový druh N. branchiphila n. sp. Pro identifikaci jednotlivých druhů byly připraveny diagnostické primery.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EA - Morphology and cytology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/IAA6022202" target="_blank" >IAA6022202: Morphological and molecular identification of free-living amoebae infecting fishes</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal of Fish Diseases

ISSN

0140-7775

e-ISSN

—

Volume of the periodical

28

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

16

Pages from-to

49-64

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—