Highly abundant pea LTR retrotransposon Ogre is constitutively transcribed and partially spliced

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077352%3A_____%2F03%3A00102819" target="_blank" >RIV/60077352:_____/03:00102819 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
Highly abundant pea LTR retrotransposon Ogre is constitutively transcribed and partially spliced
Original language description
We have isolated and characterized a novel giant retroelement, named Ogre, which is over 22 kb long and makes up at least 5% of the pea :Pisum sativum L. genome. This element can be classified as a Ty3/gypsy-like LTR retrotransposon based on the presenceof long terminal repeats :LTRs and the order of the domains coding for typical retrotransposon proteins.
Czech name
LTR-retrotransposon Ogre z genomu hrachu je konstitutivně transkribován a částečně sestřiháván
Czech description
Práce popisuje izolaci a charakterizaci nového gigantického retroelementu, pojmenovaného Ogre, který je dlouhý přes 22 kb a jehož sekvence tvoří nejméně 5% genomu hrachu (Pisum sativum). Jde o LTR-retrotransposon typu Ty3/gypsy, který vykazuje několik neobvyklých strukturních rysů, jakými jsou např. extrémně dlouhé LTRs, přítomnost nadbytečného ORF a intronu, který je z části transkriptů sestřihován.

Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—

Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year
2003
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)