Structural variability of subtelomeres applied for genotyping of selected potato varieties

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F05%3A%230000004" target="_blank" >RIV/60109807:_____/05:#0000004 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru

Original language description

Subtelomerické oblasti se vyznačují relativně vysokým stupněm polymorfismu vzhledem ke zvýšené frekvenci rekombinací v těchto chromozomálních lokusech. Při hledání molekulárních markerů použitelných pro genotypizaci odrůd bramboru se autoři zaměřili na dva možné zdroje polymorfismů vyskytující se v této oblasti: 1. uspořádání bloků subtelomerového chromatinu; 2. struktura rozhraní telomera-subtelomera. S použitím telomerového primeru v kombinaci s některým ze ST3- specifických primerů byly dále amplifikovány a následně klonovány hraniční úseky mezi telomerou a subtelomerou. Výsledkem sekvenční analýzy získaných klonů byla charakterizace nové telomer-asociované sekvence (FIN2). Popsané kombinace sekvenčně-specifických primerů mohou být použity pro rychlou, levnou a reprodukovatelnou genotypizaci vybraných odrůd bramboru.

Czech name

Strukturní variabilita subtelomer použitých pro genotypizaci vybraných odrůd bramboru

Czech description

Subtelomerické oblasti se vyznačují relativně vysokým stupněm polymorfismu vzhledem ke zvýšené frekvenci rekombinací v těchto chromozomálních lokusech. Při hledání molekulárních markerů použitelných pro genotypizaci odrůd bramboru se autoři zaměřili na dva možné zdroje polymorfismů vyskytující se v této oblasti: 1. uspořádání bloků subtelomerového chromatinu; 2. struktura rozhraní telomera-subtelomera. S použitím telomerového primeru v kombinaci s některým ze ST3- specifických primerů byly dále amplifikovány a následně klonovány hraniční úseky mezi telomerou a subtelomerou. Výsledkem sekvenční analýzy získaných klonů byla charakterizace nové telomer-asociované sekvence (FIN2). Popsané kombinace sekvenčně-specifických primerů mohou být použity pro rychlou, levnou a reprodukovatelnou genotypizaci vybraných odrůd bramboru.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GE - Plant cultivation

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Czech Journal of Genetics and Plant Breeding

ISSN

ISSN1212-1975

e-ISSN

—

Volume of the periodical

41

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

6

Pages from-to

17-22

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—