Diagnosis of Potato spindle tuber viroid by means of molecular genetic techniques (RT-PCR and QRT-PCR)

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F06%3A%230000047" target="_blank" >RIV/60109807:_____/06:#0000047 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Diagnóza viroidu vřetenovitosti hlíz bramboru molekulárně genetickými technikami (RT-PCR a RT-PCR v reálném čase)

Original language description

Cílem vlastní práce bylo vybrat a optimalizovat rychlou a citlivou laboratorní metodu pro spolehlivou detekci tohoto karanténního onemocnění bramboru. Jako experimentální materiály byly využity 2 typové izoláty viroidní vřetenovitosti hlíz bramboru (PSTVd) ze sbírky virových a viroidních patogenů kat. č. VIRUBRA 7/001 a 7/002 vedené v in-vitro podmínkách. Naše práce porovnávala metody izolace NA pomocí magnetických částic (MagExtractor-RNA Kit - Toyobo) s využitím přístroje KingFisher mL a ?tradiční? postup tj. izolace NA pomocí komerčních souprav založených na specifické vazbě a následné eluci NA z nosičů umístěných ve speciálních kolonkách (RNeasy Plant Total RNA Kit - Qiagen). RNA byla extrahována z rostlin in vitro. Obě zkoušené metody poskytovalyRNA pro následnou RT-PCR bez zjištění vlivu přítomnosti rostlinných inhibitorů. Předností obou těchto metod je jejich malá časová náročnost a srovnatelná cena. Obě výše zmíněné techniky byly vhodné pro následnou RT-PCR.

Czech name

Diagnóza viroidu vřetenovitosti hlíz bramboru molekulárně genetickými technikami (RT-PCR a RT-PCR v reálném čase)

Czech description

Cílem vlastní práce bylo vybrat a optimalizovat rychlou a citlivou laboratorní metodu pro spolehlivou detekci tohoto karanténního onemocnění bramboru. Jako experimentální materiály byly využity 2 typové izoláty viroidní vřetenovitosti hlíz bramboru (PSTVd) ze sbírky virových a viroidních patogenů kat. č. VIRUBRA 7/001 a 7/002 vedené v in-vitro podmínkách. Naše práce porovnávala metody izolace NA pomocí magnetických částic (MagExtractor-RNA Kit - Toyobo) s využitím přístroje KingFisher mL a ?tradiční? postup tj. izolace NA pomocí komerčních souprav založených na specifické vazbě a následné eluci NA z nosičů umístěných ve speciálních kolonkách (RNeasy Plant Total RNA Kit - Qiagen). RNA byla extrahována z rostlin in vitro. Obě zkoušené metody poskytovalyRNA pro následnou RT-PCR bez zjištění vlivu přítomnosti rostlinných inhibitorů. Předností obou těchto metod je jejich malá časová náročnost a srovnatelná cena. Obě výše zmíněné techniky byly vhodné pro následnou RT-PCR.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Sborník abstraktů XVII. České a slovenské konference o ochraně roslin

ISBN

80-213-1516-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

386

Pages from-to

37-39

Publisher name

ČZU Praha

Place of publication

Praha

Event location

Praha

Event date

Jan 1, 2006

Type of event by nationality

EUR - Evropská akce

UT code for WoS article

—