Detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus in potato plants by Duplex Real-Time PCR with TaqMan-MGB probes
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F16%3AN0000005" target="_blank" >RIV/60109807:_____/16:N0000005 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Detekce Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus v rostlinách bramboru pomocí duplex Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami
Original language description
Bakterie Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (Cms), způsobující bakteriální kroužkovitost bramboru, patří dle směrnice EPPO mezi regulované (karanténní) A2 škodlivé organismy. Detektabilita Cms v rostlinách bramboru může být ovlivněna koncentrací a migrací bakterie v pletivech a případnou inhibicí PCR. Cms může vyvolávat bezpříznakové infekce a tím snadno unikat pozornosti. Cílem práce bylo ověření a inovace detekce Cms v pletivech bramboru pomocí Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami v duplexu s interní kontrolou. Použitý modifikovaný extrakční postup byl vhodný pro izolaci kvalitní DNA z hlíz nebo stonků bramboru. Výsledky PCR analýz ukázaly vysokou specifičnost a spolehlivost metody. Pomocí interní kontroly byla snadná kontrola kvality DNA a inhibice PCR reakce. Duplex Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami představuje metodu pro rychlou a citlivou detekci Cms v hlízách a stoncích bramboru.
Czech name
Detekce Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus v rostlinách bramboru pomocí duplex Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami
Czech description
Bakterie Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (Cms), způsobující bakteriální kroužkovitost bramboru, patří dle směrnice EPPO mezi regulované (karanténní) A2 škodlivé organismy. Detektabilita Cms v rostlinách bramboru může být ovlivněna koncentrací a migrací bakterie v pletivech a případnou inhibicí PCR. Cms může vyvolávat bezpříznakové infekce a tím snadno unikat pozornosti. Cílem práce bylo ověření a inovace detekce Cms v pletivech bramboru pomocí Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami v duplexu s interní kontrolou. Použitý modifikovaný extrakční postup byl vhodný pro izolaci kvalitní DNA z hlíz nebo stonků bramboru. Výsledky PCR analýz ukázaly vysokou specifičnost a spolehlivost metody. Pomocí interní kontroly byla snadná kontrola kvality DNA a inhibice PCR reakce. Duplex Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami představuje metodu pro rychlou a citlivou detekci Cms v hlízách a stoncích bramboru.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2016
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Volume of the periodical
LXIV
Issue of the periodical within the volume
12
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
4
Pages from-to
229-232
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—