Possibilities of detection and quantification of Rhizoctonia solani in soil
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F23%3AN0000054" target="_blank" >RIV/60109807:_____/23:N0000054 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/62156489:43210/23:43924205
Result on the web
<a href="http://www.mendelu.cz" target="_blank" >http://www.mendelu.cz</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Možnosti detekce a kvantifikace Rhizoctonia solani v půdě
Original language description
Cílem této práce bylo optimalizovat metodu qPCR pro kvantifikaci R. solani v půdě. Hodnocení bylo provedeno u vzorků odebraných ze 3 stanovišť S1, S2 a S3. Pro ověření účinnosti izolace DNA a následné kvantifikace pomocí qPCR byla část vzorku půdy S1 kontaminován myceliem R.solani. Kalibrace byla provedena pomocí DNA izolované z mycelia tohoto patogenu. DNA ze vzorků půdy byla izolována pomocí kitu AllPrep® PoverFecal®DNA/RNA Kit a pro kvantifikaci byla optimalizována metoda relativní kvantifikace. Výsledky byly vyjádřeny poměrem k vybranému vzorku kalibrační křivky, který odpovídal koncentraci DNA 0,5 ngμl-1. Ve dvou vzorcích půdy byla prokázána DNA R solani na úrovni asi 1000x nižší oproti vnitřnímu kalibrátoru.
Czech name
Možnosti detekce a kvantifikace Rhizoctonia solani v půdě
Czech description
Cílem této práce bylo optimalizovat metodu qPCR pro kvantifikaci R. solani v půdě. Hodnocení bylo provedeno u vzorků odebraných ze 3 stanovišť S1, S2 a S3. Pro ověření účinnosti izolace DNA a následné kvantifikace pomocí qPCR byla část vzorku půdy S1 kontaminován myceliem R.solani. Kalibrace byla provedena pomocí DNA izolované z mycelia tohoto patogenu. DNA ze vzorků půdy byla izolována pomocí kitu AllPrep® PoverFecal®DNA/RNA Kit a pro kvantifikaci byla optimalizována metoda relativní kvantifikace. Výsledky byly vyjádřeny poměrem k vybranému vzorku kalibrační křivky, který odpovídal koncentraci DNA 0,5 ngμl-1. Ve dvou vzorcích půdy byla prokázána DNA R solani na úrovni asi 1000x nižší oproti vnitřnímu kalibrátoru.
Classification
Type
J<sub>ost</sub> - Miscellaneous article in a specialist periodical
CEP classification
—
OECD FORD branch
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK21010083" target="_blank" >QK21010083: Ecological protection of ware potatoes as a healthy vegetable against selected soilborne and seedborne pathogens</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2023
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Volume of the periodical
70
Issue of the periodical within the volume
12
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
8
Pages from-to
93-100
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—