STUDY OF MITOCHONDRIAL DNA NON-CODING REGIONS VARIABILITY IN SELECTED GENE RESOURCES OF GENUS SOLANUM
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41210%2F11%3A51431" target="_blank" >RIV/60460709:41210/11:51431 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM
Original language description
Kódující oblasti v mitochondriálním genomu jsou vysoce konzervativní mezi druhy i rody. Nicméně sekvence intronů a oblastí mezi geny jsou vysoce variabilní, protože neobsahují sekvence nezbytné pro funkci organel. Bylo zhodnoceno celkem 145 genotypů náležících k 16 druhům rodu Solanum. Analýzou markeru nad2/4/nad2/5 nebyl detekován polymorfismus. Dále byly použity pár mt primerů atp9/atp9 a pár primerů rrn5/rrn18-1. Analýzou na horizontálním agarózovém gelu, metodou SSCP a DGGE nebyl detekován polymorfismus. Posledním použitým markerem byl cox1/cox1. Restrikčním štěpením fragmentu enzymem Hinf1 byla detekována variabilita pouze u druhu S. mochiquense. Ze sekvenování fragmentu atp9/atp9 vyplývá, že tento intergenový mezerník vykazuje mezi druhy různýchčeledí relativně nízkou variabilitu, z čehož lze usuzovat na vysokou míru konzervovanosti napříč rostlinnou říší. Získané výsledky potvrzují hypotézu, že mitochondriální DNA vykazuje obecně nízkou variabilitu.
Czech name
STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM
Czech description
Kódující oblasti v mitochondriálním genomu jsou vysoce konzervativní mezi druhy i rody. Nicméně sekvence intronů a oblastí mezi geny jsou vysoce variabilní, protože neobsahují sekvence nezbytné pro funkci organel. Bylo zhodnoceno celkem 145 genotypů náležících k 16 druhům rodu Solanum. Analýzou markeru nad2/4/nad2/5 nebyl detekován polymorfismus. Dále byly použity pár mt primerů atp9/atp9 a pár primerů rrn5/rrn18-1. Analýzou na horizontálním agarózovém gelu, metodou SSCP a DGGE nebyl detekován polymorfismus. Posledním použitým markerem byl cox1/cox1. Restrikčním štěpením fragmentu enzymem Hinf1 byla detekována variabilita pouze u druhu S. mochiquense. Ze sekvenování fragmentu atp9/atp9 vyplývá, že tento intergenový mezerník vykazuje mezi druhy různýchčeledí relativně nízkou variabilitu, z čehož lze usuzovat na vysokou míru konzervovanosti napříč rostlinnou říší. Získané výsledky potvrzují hypotézu, že mitochondriální DNA vykazuje obecně nízkou variabilitu.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
GE - Plant cultivation
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2011
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Vědecké práce
ISSN
1802-940X
e-ISSN
—
Volume of the periodical
18
Issue of the periodical within the volume
—
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
10
Pages from-to
53-62
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—