Deciphering Dorin M glycosylation by mass spectrometry.
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F08%3A00021226" target="_blank" >RIV/60461373:22330/08:00021226 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/60077344:_____/08:00320700 RIV/61388971:_____/08:00320700 RIV/60076658:12310/08:00009698
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Deciphering Dorin M glycosylation by mass spectrometry.
Original language description
The soft tick, Ornithodoros moubata, is a vector of several bacterial and viral pathogens including Borrelia duttoni, a causative agent of relapsing fever and African swine fever virus. Previously, a sialic acid-specific lectin Dorin M was isolated fromits hemolymph. Here, we report on the complete characterization of the primary sequence of Dorin M. Using liquid chromatography coupled to mass spectrometry, we identified three different glycopeptides in the tryptic digest of Dorin M. The peptide, as well as the glycan part of all glycopeptides, were further fully sequenced by means of tandem mass spectrometry (MS2) and multiple-stage mass spectrometry (MS3). Two classical N-glycosylation sites were modified by high-mannose-type glycans containing up to nine mannose residues. The third site bore a glycan with four to five mannose residues and a deoxyhexose (fucose) attached to the proximal N-acetylglycosamine. The microheterogeneity at each site was estimated based on chromatographic b
Czech name
Rozluštění glykosylace Dorinu M hmotnostní spektrometrií.
Czech description
Klíšťák, Ornithodoros moubata, je přenašečem několika bakteriálních a virálních patogenů včetně Borrelia duttoni způsobujicí opakované horečky a African swine fever viru. Lektin Dorin M (specifický pro sialové kyseliny) byl již dříve izolován z hemolymfyklíšťáka. Zde přinášíme kompletní charakterizaci primární struktury Dorinu M. Pomocí kapalinové chromatografie spojené s hmotnostní spektrometrií jsme nalezly tři rozdílné glykopeptidy mezi tryptickými štěpy Dorinu M. Peptidy, stejně jako jejich glykanová část, byly kompletně osekvenovány pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie (MS(2)) a multiple-stage hmotnostní spektrometrie (MS(3)). Byla nalezena 2 klasická N-glykosylovaná místa nesoucí mannosový typ sacharadových řetězců s až devíti mannosovými zbytky. Třetí místo neslo sacharidový řezězec obsahující 4 - 5 mannosových zbytků a fukosu na proximálním N-acetylglykosaminu. Mikroheterogenita na každém místě byla určena na základě chromatografického chování jednotlivých glykoforem. Čtv
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
CB - Analytical chemistry, separation
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
European Journal of Mass Spectrometry
ISSN
1469-0667
e-ISSN
—
Volume of the periodical
14
Issue of the periodical within the volume
6
Country of publishing house
GB - UNITED KINGDOM
Number of pages
10
Pages from-to
—
UT code for WoS article
000262813100003
EID of the result in the Scopus database
—