Molecular dynamics of potential models with polarizability: comparison of methods
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22340%2F04%3A00011109" target="_blank" >RIV/60461373:22340/04:00011109 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Molecular dynamics of potential models with polarizability: comparison of methods
Original language description
Three methods for molecular dynamics of models with induced dipoles are optimized for accuracy and performance and compared: the predicted iteration method, the always stable predictor-corrector method, and the extended Lagrangian method (Car-Parrinelloapproach). The comparison criteria include thermodynamic quantities (energy, pressure, averaged induced dipoles), control quantities (total energy conservation, energy equipartition, errors in induced dipoles), and computer time. We recommend the alwaysstable predictor-corrector method as a compromise between accuracy, speed, and simulation consistency.
Czech name
Molekulova dynamika potencialovych modelu s polarizovatelnosti: srovnani metod
Czech description
Optimalizovali a porovnali jsme tři metody pro molekulovou dynamiku modelů s indukovanými dipóly: metodu predikovaných iterací, vždy stabilní metodu prediktor-korektor a metodu rozšířeného Lagrangiánu (přístup Cara-Parinella). Kritéria srovnání zahrnujítermodynamické veličiny (energii, tlak, střední indukovaný dipól), kontrolní veličiny (zachování celkové energie, ekvipartiční teorém, chyby indukovaných dipólů) a počítačový čas. Doporučujeme vždy stabilní metodu prediktor-korektor jako kompromis mezi přesností, rychlostí a konzistencí simulace.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/LN00A032" target="_blank" >LN00A032: Structure and dynamics of complex molecular systems and biomolecules</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2004
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Journal Mol.Liq.
ISSN
0167-7322
e-ISSN
—
Volume of the periodical
109
Issue of the periodical within the volume
1
Country of publishing house
NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS
Number of pages
10
Pages from-to
63-72
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—