The DNA - porphyrin interactions studied by vibrational and electronic circular dichroism spectroscopy

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22340%2F05%3A00014755" target="_blank" >RIV/60461373:22340/05:00014755 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

The DNA - porphyrin interactions studied by vibrational and electronic circular dichroism spectroscopy

Original language description

The interactions of three different porphyrins, without axial ligands - 5,10,15,20-tetrakis(1-methylpyridinium-4-yl)porphyrin-Cu(II) tetrachloride (Cu(II)TMPyP), with axial ligands - 5,10,15,20-tetrakis(1-methylpyridinium-4-yl)porphyrin-Fe(III) pentachloride (Fe(III)TMPyP), and with bulky meso substituents - 5,10,15,20-tetrakis(N,N,N-trimethylanilinium-4-yl)porphyrin tetrachloride (TMAP), with calf thymus DNA were studied by combination of vibrational circular dichroism (VCD) and electronic circular dichroism (ECD) spectroscopy and by IR and UV-VIS absorption spectroscopy. It was shown that Cu(II)TMPyP prefers the intercalative binding mode with DNA in the GC rich regions and the intercalative sites are saturated at the c(DNA)/c(Cu(II)TMPyP) ratio ~ 3/1, where c(DNA) and c(Cu(II)TMPyP) are total molar concentrations of nucleic acid in base pairs and of porphyrin, respectively. Fe(III)TMPyP does not intercalate between the GC base-pairs but binds to DNA in the minor groove. At higher c(

Czech name

Studie interakcí DNA - porfyrin metodami vibračního a elektronového cirkulárního dichroismu

Czech description

Interakce tří různých porfyrinů - pofyrinu bez axiálních ligandů 5,10,15,20-tetrakis(1-methylpyridinium-4yl)porfyrinu-Cu(II) tetrachloridu (Cu(II)TMPyP), s axiálními ligandy 5,10,15,20-tetrakis(1-methylpyridinium-4-yl)porfyrinu-Fe(III) pentachloridu (Fe(III)TMPyP) a s velkými meso substituenty 5,10,15,20-tetrakis(N,N,N-trimethylanilinium-4-yl)porfyrinu tetrachloridu (TMAP) - s DNA byly měřeny kombinací vibračního a elektronického cirkulárního dichroismu a za pomoci IČ a UV-VIS absorpční spektroskopie. Bylo zjištěno, že Cu(II)TMPyP preferuje interkalační způsob vazby na DNA do oblasti bohaté na GC páry. Interkalační místa byla saturována při poměru c(DNA)/c(Cu(II)TMPyP) ~ 3/1, kde c(DNA) a c(Cu(II)TMPyP) jsou látkové koncentrace bází nukleové kyseliny aporfyrinu. Fe(III)TMPyP neinterkaluje mezi GC páry bází, ale váže se do vnějšího žlábku DNA. Při vyšších poměrech c(DNA)/c(TMAP) se TMAP váže do vnějšího žlábku DNA, avšak při poměrech nižších poskytuje vazbu do vnitřního žlábku a extern

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

CB - Analytical chemistry, separation

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Collection of Czechoslovak Chemical Communications

ISSN

0010-0765

e-ISSN

—

Volume of the periodical

70

Issue of the periodical within the volume

11

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

12

Pages from-to

1799-1810

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—