Vibrational and Electronic Circular Dichroism and Absorption Spectral Study of the DNA - 5, 10, 15, 20-tetrakis(1-methylpyridinium-4-yl)porphyrin Interaction

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22340%2F05%3A00014756" target="_blank" >RIV/60461373:22340/05:00014756 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Vibrational and Electronic Circular Dichroism and Absorption Spectral Study of the DNA - 5, 10, 15, 20-tetrakis(1-methylpyridinium-4-yl)porphyrin Interaction

Original language description

Vibrational circular dichroism (VCD), electronic circular dichroism (ECD) and IR and UV-Vis absorption spectra were measured for complexes of DNA with 5, 10, 15, 20-Tetrakis(1-methylpyridinium-4-yl)porphyrin (TMPyP) at the [DNA]/[TMPyP] ratios 2/1 - 10/1. The nitrogen base and phosphate spectral regions in IR and the Soret band and DNA regions were studied in UV-Vis. The VCD spectra indicate the priority of intercalation to external minor groove binding and the saturation of the intercalating sites forthe [DNA]/[TMPyP] = 4/1 - 5/1. The combination of spectroscopic results proved that all three binding modes, intercalation, minor groove binding and external binding to the phosphate backbone, take place for the ratio 3/1. It was shown that the melting point of the DNA - TMPyP complex is increased compared to pure DNA. The relative temperature stability of minor groove binding is smaller than of intercalation. The AT base-pair hydrogen bonds were disrupted at low pH for DNA - TMPyP compl

Czech name

Vibračně a elektronově cirkulárně dichroická a absorpční spektrální studie interakcí DNA s 5,10,15,20-tetrakis(1-methylpyridinium-4-yl)porfyrinem

Czech description

Komplexy DNA s 5,10,15,20-tetrakis(1-methylpyridinium-4-yl)porfyrinem (TMPyP), při poměrech [DNA]/[TMPyP] = 2/1 - 10/1, byly měřeny metodami vibračního cirkulárního dichroismu (VCD), elektronového cirkulárního dichroismu (ECD), infračervené a UV-Vis absorpční spektroskopie. Infračervenou spektroskopií byly zkoumány oblasti charakteristických vibrací dusíkových bází a fosfátové skupiny, UV-Vis spektroskopií byly zkoumány oblasti Soretova pásu a oblast absorpce DNA. Z VCD spekter bylo patrné upřednostněníinterkalační vazby před vazbou do vnějšího žlábku a saturace interkalačních míst pro poměr [DNA]/[TMPyP] = 4/1 - 5/1. Z výsledků různých spektroskopických měření plyne, že při poměru 3/1 nastaly všechny tři typy vazeb, kterými jsou: interkalace, vazba do vnějšího žlábku a vnější vazba na fosfátovou páteř. Bylo prokázáno, že teplota tání komplexu DNA - TMPyP je ve srovnání s čistou DNA vyšší. Teplotní stabilita vazby TMPyP do vnějšího žlábku je menší než teplotní stabilita interkalace. N

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

CB - Analytical chemistry, separation

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2005

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal Mol.Struct.

ISSN

0022-2860

e-ISSN

—

Volume of the periodical

748

Issue of the periodical within the volume

1-3

Country of publishing house

NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS

Number of pages

9

Pages from-to

17-25

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—