Modeling of communication and aggregation of cells by DEM method
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22340%2F07%3A00018114" target="_blank" >RIV/60461373:22340/07:00018114 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Modeling of communication and aggregation of cells by DEM method
Original language description
The amoebae Dictyostelium discoideum is a simple micro-organism enabling well the studies of the non-linearity, excitability and self-organization driven by reaction-diffusion processes. Very interesting phase of its lifecycle is the so-called aggregation phase. During this phase the periodic secrete of cyclic adenosin-3',5'-monophosphate (cAMP) occurs in startved cells. This cAMP initiates the propagation of excitation wave through the layer of the cells. Affected cells respond by the movement in the direction of the gradient of cAMP and by the synthesis of the additional cAMP. After the passage of several waves the aggregates of cells are formed. In our work we compare the experimental observation of the aggregation behavior of Dictyostelium discoideum cels with the results of simulations based on the discrete element method.
Czech name
Modelování komunikace a agregace buněk metodou DEM
Czech description
Améba Dictyostelium discoideum je jednoduchým mikroorganismes umožňujícím studie nelineárního chování, excitability a samoorganizace řízené reakčně-difuzními procesy. Zajímavou životní fází tohoto mikroorganismu je tzv. agregační fáze, během níž probíháperiodické uvolňování cAMP z hladovějících buněk. Tato cAMP inicializuje propagaci excitabilních vln ve vrstvě mikroorganismů. Další buňky reagují na signál cAMP svým pohybem ve směru gradientu cAMP a syntézou dalšího cAMP. Po průchodu několika vln jsouvytvořeny agregáty cAMP. V naší práci porovnáváme experimentální pozorování chování buněk Dictyostelium discoideum se simulacemi založenými na metodě diskrétních elementů.
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
CI - Industrial chemistry and chemical engineering
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/KAN208240651" target="_blank" >KAN208240651: Study of interactions of biological macromolecules and nanolayers with a view to research of polymer microfluidic biosensors and therapeutic nanoparticles</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
Sborník workshopu: Inženýrské mikrosystémy pro biotechnologické aplikace
ISBN
978-80-7080-020-1
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
7
Pages from-to
120-126
Publisher name
VŠCHT Praha
Place of publication
Praha
Event location
Masarykova kolej, Praha
Event date
Jun 19, 2007
Type of event by nationality
CST - Celostátní akce
UT code for WoS article
—