Stability of nucleic acid base pairs in organic solvents: Molecular dynamics, molecular dynamics/quenching, and correlated ab initio study
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F07%3A00090320" target="_blank" >RIV/61388963:_____/07:00090320 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Stability of nucleic acid base pairs in organic solvents: Molecular dynamics, molecular dynamics/quenching, and correlated ab initio study
Original language description
The dynamic structure and potential energy surface of adenine thymine and guanine cytosine base pairs and their methylated analogues interacting with small number of organic solvents (methanol, dimethylsulfoxide and chloroform) were investigated by various theoretical approaches starting from the simple empirical methods to accurate ab initio quantum chemical calculations. All calculations confirmed previous experimental and theoretical results from the bulk solvents showing that whereas in chloroform the base pairs create hydrogen-bonded structures, in methanol, stacked structures are preferred.
Czech name
Povrch potenciální energie párů nukleových kyselin v přítomnsoti organických ropzpouštědel ? molekulová dynamika, quenching a přesné ab initio výpočty
Czech description
Za použití empirckých i ab initio metod jsme studovali povrchy potenciální energie a dynamickou strukturu nemethylovaných i methylovaných párů bází nukleových kyselin v přítomnosti molekul organických rozpouštědel ? methanolu, dimethylsulfoxidu a chloroformu. Podobně jako v roztoku se ukazuje, že v přítomnosti methanolu jsou preferovány patrové interakce mezi bázemi, zatímco v nepolárním chloroformu jsou preferovány planární vodíkově vázané komplexy páru bází.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Volume of the periodical
111
Issue of the periodical within the volume
10
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
19
Pages from-to
2591-2609
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—