All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

MedusaScore: An accurate force field-based scoring function for virtual drug screening

The result's identifiers

  • Result code in IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F08%3A00315423" target="_blank" >RIV/61388963:_____/08:00315423 - isvavai.cz</a>

  • Result on the web

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternative languages

  • Result language

    angličtina

  • Original language name

    MedusaScore: An accurate force field-based scoring function for virtual drug screening

  • Original language description

    Virtual screening is becoming an important tool for drug discovery. However, the application of virtual screening has been limited by the lack of accurate scoring functions. Here, we present a novel scoring function, MedusaScore, for evaluating protein-ligand binding. MedusaScore is based on models of physical interactions that include van der Waals, solvation, and hydrogen bonding energies. To ensure the best transferability of the scoring function, we do not use any protein-ligand experimental data for parameter training.

  • Czech name

    MedusaScore: Přesná skórovací funkce na bázi empirického potenciálu pro virtuální návrh léčiv

  • Czech description

    Virtuální testování léčiv se stalo důležitým nástrojem pro racionální návrh léčiv. Nicméně jeho použití je limitováno přesnou skórovací funkcí. V předkládané studii prezentujeme novou funkci, MedusaScore, k určení affinity protein-ligand. MedusaScore jezaložena na principu fyzikálně modelované interakce která zahruje van der Waalsovské, solvatační a elektrostatické příspěvky.

Classification

  • Type

    J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

  • CEP classification

    CF - Physical chemistry and theoretical chemistry

  • OECD FORD branch

Result continuities

  • Project

  • Continuities

    Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Others

  • Publication year

    2008

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data specific for result type

  • Name of the periodical

    Journal of Chemical Information and Modeling

  • ISSN

    1549-9596

  • e-ISSN

  • Volume of the periodical

    48

  • Issue of the periodical within the volume

    8

  • Country of publishing house

    US - UNITED STATES

  • Number of pages

    7

  • Pages from-to

  • UT code for WoS article

    000258697400010

  • EID of the result in the Scopus database