Virtual Screening

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F17%3A00502622" target="_blank" >RIV/68378050:_____/17:00502622 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60461373:22330/09:00022338 RIV/60461373:22310/17:43914581

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Virtuální screening

Original language description

Dominantní technikou pro identifikaci potenciálních léčiv je fyzikální screening velkých knihoven chemikálií proti biologickému cíli (high-throughput screening, HTS). Alternativní přístup, známý jako virtuální screening, je navržen tak, aby počítačově testovat velké knihovny chemikálií na sloučeniny, které doplňují cíle o známé struktuře, a experimentálně testovat ty, u kterých se předpokládá, že se budou dobře vázat. Existují dvě kategorie technik virtuálního screeningu: přístupy založené na ligandu a na struktuře. Metody založené na ligandu používají pouze informace o těch ligandech, o kterých je známo, že jsou aktivní proti danému cíli. Příklady přístupů založených na ligandech jsou vyhledávání podobností nebo modelování farmakoforů. Virtuální screening založený na struktuře vyžaduje znalost 3D struktury cílového proteinu. Typická metoda založená na struktuře je tzv. Docking, který se snaží předpovědět vazebnou afinitu mezi ligandem a jeho cílem. V tomto článku přinášíme přehled o virtuálních screeningových přístupech založených na ligandu a struktuře a diskutujeme o jejich omezení v molekulárním designu podporovaném počítačem. Vybrané metody jsou podrobněji popsány v některých dalších článcích tohoto vydání Chemických listů.

Czech name

Virtuální screening

Czech description

Dominantní technikou pro identifikaci potenciálních léčiv je fyzikální screening velkých knihoven chemikálií proti biologickému cíli (high-throughput screening, HTS). Alternativní přístup, známý jako virtuální screening, je navržen tak, aby počítačově testovat velké knihovny chemikálií na sloučeniny, které doplňují cíle o známé struktuře, a experimentálně testovat ty, u kterých se předpokládá, že se budou dobře vázat. Existují dvě kategorie technik virtuálního screeningu: přístupy založené na ligandu a na struktuře. Metody založené na ligandu používají pouze informace o těch ligandech, o kterých je známo, že jsou aktivní proti danému cíli. Příklady přístupů založených na ligandech jsou vyhledávání podobností nebo modelování farmakoforů. Virtuální screening založený na struktuře vyžaduje znalost 3D struktury cílového proteinu. Typická metoda založená na struktuře je tzv. Docking, který se snaží předpovědět vazebnou afinitu mezi ligandem a jeho cílem. V tomto článku přinášíme přehled o virtuálních screeningových přístupech založených na ligandu a struktuře a diskutujeme o jejich omezení v molekulárním designu podporovaném počítačem. Vybrané metody jsou podrobněji popsány v některých dalších článcích tohoto vydání Chemických listů.

Type

J_imp - Article in a specialist periodical, which is included in the Web of Science database

CEP classification

—

OECD FORD branch

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Project

<a href="/en/project/LO1220" target="_blank" >LO1220: CZ-OPENSCREEN: National infrastructure for chemical biology</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2017

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Chemické listy

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Volume of the periodical

111

Issue of the periodical within the volume

11

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

9

Pages from-to

738-746

UT code for WoS article

000418342800006

EID of the result in the Scopus database

—