Plant DNA flow cytometry and estimation of nuclear genome size
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F05%3A00026469" target="_blank" >RIV/61389030:_____/05:00026469 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Plant DNA flow cytometry and estimation of nuclear genome size
Original language description
Background: DNA flow cytometry describes the use of flow cytometry for estimation of DNA quantity in cell nuclei. The method involves preparation of aqueous suspensions of intact nuclei whose DNA is stained using a DNA fluorochrome. The nuclei are classified according to their relative fluorescence intensity or DNA content. Because the sample preparation and analysis is convenient and rapid, DNA flow cytometry has become a popular method for ploidy screening, detection of mixoploidy and aneuploidy, cellcycle analysis, assessment of the degree of polysomaty, determination of reproductive pathway, and estimation of absolute DNA amount or genome size. While the former applications are relatively straightforward, estimation of absolute DNA amount requiresspecial attention to possible errors in sample preparation and analysis. - Scope: The article reviews current procedures for estimation of absolute DNA amounts in plants using flow cytometry, with special emphasis on preparation of ...
Czech name
Analýza DNA pomocí průtokové cytometrie a stanovení velikosti jaderného genomu
Czech description
Průtoková cytometrie DNA umožňuje stanovení množství DNA v buněčných jádrech. Metoda spočívá v přípravě suspenze intaktních jader jejichž DNA je barvena pomocí fluorochromu vážícího se na DNA. Jádra jsou klasifikována podle relativní intenzity fluorescence a tedy obsahu DNA. Díky tomu, že je příprava vzorku snadná a rychlá, průtoková cytometrie DNA se stala populární metodou pro analýzu ploidie, identifikaci mixoploidie a aneuploidie, analýzu kinetiky buněčného cyklu, stanovování rozsahu polysomatie, určení způsobu rozmnožování a stanovení obsahu jaderné DNA v absolutních jednotkách neboli velikosti genomu. Tento článek podává přehled postupů pro měření obsahu DNA u rostlin v absolutních jednotkách pomocí průtokové cytometrie s důrazem na přípravu suspenze jader, stechiometrické barvení DNA a použití standardů DNA. Dále diskutuje metodické chyby, které ovlivňují analýzu vnitrodruhové variability velikosti genomu a problémy s použitím průtokové cytometrie DNA v terénu. Přesné stanove...
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2005
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Annals of Botany
ISSN
0305-7364
e-ISSN
—
Volume of the periodical
95
Issue of the periodical within the volume
-
Country of publishing house
GB - UNITED KINGDOM
Number of pages
12
Pages from-to
99-110
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—