Cot-based cloning and sequencing of the short arm of wheat chromosome 1B

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F07%3A00305106" target="_blank" >RIV/61389030:_____/07:00305106 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Cot-based cloning and sequencing of the short arm of wheat chromosome 1B

Original language description

Sequencing of cereal genomes is not a feasible task due to their large size and high content of repetitive DNA sequences. There are two basic approaches to simplify analysis of such genomes: reduced representation approaches, such as EST sequencing, methyl filtration and Cot-based cloning and sequencing; on the other side there is analysis of genomes in a step-wise manner, e.g. through creation of chromosome-specific genomic resources. Combination of both approaches ? i.e. Cot-based cloning and sequencing of DNA obtained from a chromosome-arm-specific BAC library ? was tested in this work.

Czech name

Klonování a sekvenování Cot frakce DNA krátkého ramene chromozómu pšenice 1B

Czech description

Sekvenování genomů obilovin je komplikováno jejich velikostí a vysokým obsahem repetitivních sekvencí DNA. Pro zjednodušení analýzy takových genomů jsou možné dva základní přístupy: přístup založený na snížení komplexity jako je sekvenování EST, methyl filtrace a tzv. Cot klonování a sekvenování a přístup spočívající v postupné analýze menších částí genomu, například pomocí chromozómově specifických knihoven DNA. Možnost kombinovat oba přístupy, tj. Cot klonování a sekvenování DNA, která byla získána zchromozómově specifické BAC knihovny, byla ověřována v této práci.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GP521%2F05%2FP257" target="_blank" >GP521/05/P257: Analysis of molecular structure of the short arm of wheat chromosome 1B (Triticum aestivum)</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Plant, Soil and Environment

ISSN

1214-1178

e-ISSN

—

Volume of the periodical

53

Issue of the periodical within the volume

10

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

5

Pages from-to

437-441

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—