OLGEN Coverage Limit calculator
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989100%3A27240%2F19%3A10242998" target="_blank" >RIV/61989100:27240/19:10242998 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/61989592:15110/19:73598448
Result on the web
<a href="http://app.olgen.cz/clc/" target="_blank" >http://app.olgen.cz/clc/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
OLGEN Coverage Limit kalkulátor
Original language description
Software umožňuje spočítat potřebné pokrytí osekvenovaného úseku DNA k detekci somatických mutací v lidském genomu. V software je implementován nově navržený pravděpodobností model, který pro danou n-procentní somatickou mutaci a definovanou chybovost měření, spočítá potřebné pokrytí sekvencemi.
Czech name
OLGEN Coverage Limit kalkulátor
Czech description
Software umožňuje spočítat potřebné pokrytí osekvenovaného úseku DNA k detekci somatických mutací v lidském genomu. V software je implementován nově navržený pravděpodobností model, který pro danou n-procentní somatickou mutaci a definovanou chybovost měření, spočítá potřebné pokrytí sekvencemi.
Classification
Type
R - Software
CEP classification
—
OECD FORD branch
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Result continuities
Project
<a href="/en/project/NV16-32339A" target="_blank" >NV16-32339A: Impact of functional polymorphisms influencing inflammation and oxidative stress on outcome and selection of treatment in chronic lymphocytic leukemia</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2019
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
014/25-11-2019_SW
Technical parameters
Software je implementován v jazyce Python pro platformu Windows. Software lze nainstalovat pomocí všeobsahujícího instalačního souboru nebo využít webovou aplikaci.
Economical parameters
Tento software reaguje na potřebu stanovení minimálního potřebného pokrytí vybraného úseku genomu při sekvenování lidské DNA, které by zajistilo odlišení nesprávně detekovaných somatických mutací od skutečných mutací v rámci předdefinovaných parametrů. Použití software snižuje riziko potřeby opětovného, nákladného sekvenování zkoumaného genomu.
Owner IČO
61989100
Owner name
Vysoká škola báňská - Technická univerzita, Fakulta elektrotechniky a informatiky, Katedra informatiky