MCP-1 -2518 A/G single nucleotide polymorphism in Slovak patients with systemic sclerosis.
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15110%2F08%3A00007003" target="_blank" >RIV/61989592:15110/08:00007003 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
MCP-1 -2518 A/G single nucleotide polymorphism in Slovak patients with systemic sclerosis.
Original language description
Recent study in a group of German patients with SSc has implicated the SNP in the MCP-1 gene (-2518 A to G) as a factor of susceptibility to SSc. Reflecting the need for replication of genetic association studies, we investigated if this SNP is associated with SSc in another Caucasian population. MCP-1 -2518 A/G genotypes were determined using PCR-SSP in 46 SSc patients and in 449 healthy subjects, all unrelated and of Slovak (Slavonic) origin. The distribution of MCP-1 -2518 A/G genotypes complied withthe Hardy-Weinberg equilibrium both in patient and healthy control groups. There was no difference in MCP-1 -2518*G allele frequency between SSc patients and healthy subjects (patients: 0.23; controls: 0.24; p>0.05). Furthermore, MCP-1 -2518 GG homozygotes were similarly represented among SSc patients and healthy subjects (p>0.05). The association of MCP-1 -2518 A/G SNP with SSc observed originally in German population was not replicated in the Slovak population.
Czech name
MCP-1 -2518 A/G polymorfismus u slovenských pacientů se systémovou sklerózou
Czech description
Monocyte chemoattractent protein (MCP)-1/CCL2, chemoatraktant pro mononukleární buňky, se významně podílí na imunitní reakci u systémové sklerózy (SS). V německé populaci byla popsána souvislost mezi SS a přítomností alely G na pozici -2518 genu kódujícího MCP-1. Cílem práce bylo zjistit, zda je tato asociace přítomna také ve slovenské populaci. MCP-1 -2518 A/G jednonukleotidový polymorfismus (SNP) byl typizován u 46 pacientů a 449 zdravých kontrolních jedinců pomocí PCR se sekvenčně specifickými primery. Rozdíly v alelické a genotypové frekvenci byly hodnoceny pomocí 2 testu s korekcí dle Woolf-Haldane. Zastoupení MCP-1 -2518 genotypů bylo u našich pacientů a kontrol v Hardy-Weinbergově rovnováze. Alela G se vyskytovala se stejnou frekvencí jak u pacientů tak u zdravých jedinců (pacienti: 0,23; kontrolní skupina: 0,24; p>0,05). Mezi pacienty a kontrolní skupinou nebyly rozdíly ani v četnosti homozygotů (p>0,05). Tato práce nepotvrdila souvislost mezi MCP-1 -2518 SNP A/G a systémovou s
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EC - Immunology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA310%2F05%2F2614" target="_blank" >GA310/05/2614: Expression-profiling of chemokine ligands and receptors in pulmonary sarcoidosis</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Mediators of Inflammation
ISSN
0962-9351
e-ISSN
—
Volume of the periodical
2008
Issue of the periodical within the volume
204063
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
1
Pages from-to
—
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—