Bacterial community analysis in river hyporheic sediments - the influence of depth and particle size.

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F07%3A00004965" target="_blank" >RIV/61989592:15310/07:00004965 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Bacterial community analysis in river hyporheic sediments - the influence of depth and particle size.

Original language description

The abundance, distribution and bacterial community structure of hyporheic sediments was characterized by both DAPI-staining and fluorescence in situ hybridization (FISH) with fluorescently labelled 16S rRNA-targeted oligonucleotide probes. The total abundance of bacteria was dependent on both particle size and depth from which each size fraction was sampled, and showed no clear trend with increasing sediment depth. The abundance of sediment-associated Eubacteria (on average 35 % of DAPI-stained cells)declined with depth, while Archaea (on average 8% of DAPI-stained cells) showed no gradient in abundance with increasing depth. Our findings confirm that Archaea may occur commonly within well-oxygenated hyporheic sediments.

Czech name

Analýza bakteriálního společenstva v říčních hyporheických sedimentech. ? vliv hloubky a velikosti částic.

Czech description

Abundance, distribuce a struktura bakteriálního společenstva v hypohrheických sedimentech byly charakterizovány barvením DAPI a FISH s fluorescentně zančenými 16S rRNA oligonukleotidovými sondami. Celková abundance bakterií byla závislá na velikosti částic a hloubce, ze které byly každá frakce vzorkována a neukazovyla žádný jasný trend s hloubkou sedimentu. Abundance Eubacteria (v průměru 35 % DAPI obarvených buněk) klesal s hloubkou, zatímco Archaea (v průměru 8 % DAPI obarvených buněk) ukazovaly žádnýgradient s hloubkou. Naše výsledky potvrzují, že Archaea se mohou běžně vyskytovat v relativně dobře oxických zónách hyporheických sedimentů.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

DA - Hydrology and limnology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Acta Universitatis Carolinaeana Environmentalica

ISSN

0862-6529

e-ISSN

—

Volume of the periodical

21

Issue of the periodical within the volume

N

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

10

Pages from-to

47-56

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—