Genetic variability of Plum pox virus isolates in the Czech Republic

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F08%3A00005541" target="_blank" >RIV/61989592:15310/08:00005541 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
Genetic variability of Plum pox virus isolates in the Czech Republic
Original language description
Plum pox virus (PPV), the causal agent of Sharka disease, is an important pathogen of stone fruit trees. In this study, 24 new Czech PPV isolates from five different orchards were collected and characterized, molecularly. PPV-D isolates were identified in all orchards studied; whereas PPV-Rec isolates were identified in only two of them. A phylogenetic analysis on (Cter) NIb-(Nter) CP was performed. Three Czech PPV-D isolates BOH11CZ, BOH12CZ, and BOH13CZ diverged into a significantly separated cluster.PPV-Rec isolates formed a fairly homogenous group. However, the Bohutice and the Lipov PPV-Rec isolates clustered in two significantly separated branches.
Czech name
Genetikcá variabilita izolátů šarky švestky v České republice
Czech description
Šarka švestky je významným patogenem peckovin. V této studii bylo na molekulární úrovni charakterizováno 24 nových českých izolátů pocházejících z pěti různých sadů. Izoláty příslušející ke kmeni PPV-D byly nalezeny ve všech sadech, kdežto izoláty příslušející k PPV-Rec byly nalezeny pouze ve dvou z nich. Byla provedena fylogenetická analýza (Cter) NIb-(Nter) CP oblasti.

Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EE - Microbiology, virology
OECD FORD branch
—

Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)