Polymorphism of microsatellite markers in collection of genetic resources of pepper (Capsicum annuum L.)

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F09%3A00156125" target="_blank" >RIV/62156489:43210/09:00156125 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Polymorfizmus mikrosatelitních markerů v kolekci genových zdrojů papriky (Capsicum annuum L.)

Original language description

V kolekci 41 genových zdrojů papriky (Capsicum annuum L.) byla detekována genetická variabilita pomocí mikrosatelitních markerů. Tři mikrosatelitní markery (Hpms 1-1, Hpms 1-168 a Hpms 1-274) byly uniformní u všech analyzovaných genotypů. Ostatní mikrosatelitní markery poskytovaly od 2 do 8 alel. Celkem bylo detekováno 28 alel, což je v průměru 3,5 alely na jeden mikrosatelitní lokus. Velikost amplifikovaných produktů se pohyboval v rozmezí 172 -- 340 bp. Nejvyšší počet alel byl detekován pomocí primerůHmps 1-5 (8 alel) a Hpms 2-21 (7 alel). Na základě statistického vyhodnocení byl sestaven dendrogram podobnosti. Rozložení analyzovaných genotypů v dendrogramu ukazuje vyšší stupeň podobnosti mezi některými genotypy v kontrastu s jinými genotypy se stejným označením. Molekulární data byla doplněna o morfologický popis podle klasifikátoru pro rod Capsicum. Výsledky ukazují na možnost duplicit v rámci studované kolekce genových zdrojů papriky.

Czech name

Polymorfizmus mikrosatelitních markerů v kolekci genových zdrojů papriky (Capsicum annuum L.)

Czech description

V kolekci 41 genových zdrojů papriky (Capsicum annuum L.) byla detekována genetická variabilita pomocí mikrosatelitních markerů. Tři mikrosatelitní markery (Hpms 1-1, Hpms 1-168 a Hpms 1-274) byly uniformní u všech analyzovaných genotypů. Ostatní mikrosatelitní markery poskytovaly od 2 do 8 alel. Celkem bylo detekováno 28 alel, což je v průměru 3,5 alely na jeden mikrosatelitní lokus. Velikost amplifikovaných produktů se pohyboval v rozmezí 172 -- 340 bp. Nejvyšší počet alel byl detekován pomocí primerůHmps 1-5 (8 alel) a Hpms 2-21 (7 alel). Na základě statistického vyhodnocení byl sestaven dendrogram podobnosti. Rozložení analyzovaných genotypů v dendrogramu ukazuje vyšší stupeň podobnosti mezi některými genotypy v kontrastu s jinými genotypy se stejným označením. Molekulární data byla doplněna o morfologický popis podle klasifikátoru pro rod Capsicum. Výsledky ukazují na možnost duplicit v rámci studované kolekce genových zdrojů papriky.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2009

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Acta fytotechnica et zootechnica

ISSN

1336-9245

e-ISSN

—

Volume of the periodical

12

Issue of the periodical within the volume

Suppl. 1

Country of publishing house

SK - SLOVAKIA

Number of pages

7

Pages from-to

—

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—