Studies of candidate sequences from wheat anthocyanin bisynthetic pathway

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F12%3A00192817" target="_blank" >RIV/62156489:43210/12:00192817 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Studium kandidátních sekvencí z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice

Original language description

Anthokyany, flavonoidní látky, jsou zodpovědné za rozdílné zbarvení obilky pšenice seté (Triticum aestivum L.). Pigmenty tvořené biosyntetickou drahou anthokyanů jsou uloženy v různých částech obilky. Purpurové pigmenty jsou akumulovány v perikarpu a modré pigmenty v aleuronové vrstvě obilky. Z kolekce Agrotestu fyto Kroměříž, s.r.o. byly vybrány vzorky jarní formy pšenice (Novosibirskaja 67, ANK-28B, Abissinskaja arrasajta, UC66049 a Tschermaks Blaukörniger Sommerweizen) s různě zbarvenými obilkami, zkterých byla izolována celková RNA pomocí fenol-chloroformové extrakce. Celková RNA byla přepsána reverzní transkripcí do cDNA. Gen pro GAPDH (glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenasu) byl vybrán jako provozní gen pro ověření úspěšnosti přepisu. Následně byla na cDNA testována optimální teplotní profil PCR reakce pro navržené primery pomocí programu Primer3 a aplikace BLAST. Na základě sekvenace PCR produktů byly získány kandidátní sekvence genů pro chalkon synthasu (82-100% podobnost), pro

Czech name

Studium kandidátních sekvencí z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice

Czech description

Anthokyany, flavonoidní látky, jsou zodpovědné za rozdílné zbarvení obilky pšenice seté (Triticum aestivum L.). Pigmenty tvořené biosyntetickou drahou anthokyanů jsou uloženy v různých částech obilky. Purpurové pigmenty jsou akumulovány v perikarpu a modré pigmenty v aleuronové vrstvě obilky. Z kolekce Agrotestu fyto Kroměříž, s.r.o. byly vybrány vzorky jarní formy pšenice (Novosibirskaja 67, ANK-28B, Abissinskaja arrasajta, UC66049 a Tschermaks Blaukörniger Sommerweizen) s různě zbarvenými obilkami, zkterých byla izolována celková RNA pomocí fenol-chloroformové extrakce. Celková RNA byla přepsána reverzní transkripcí do cDNA. Gen pro GAPDH (glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenasu) byl vybrán jako provozní gen pro ověření úspěšnosti přepisu. Následně byla na cDNA testována optimální teplotní profil PCR reakce pro navržené primery pomocí programu Primer3 a aplikace BLAST. Na základě sekvenace PCR produktů byly získány kandidátní sekvence genů pro chalkon synthasu (82-100% podobnost), pro

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GD204%2F09%2FH002" target="_blank" >GD204/09/H002: Plant Developmental Biology and Genetics</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2012

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Pšenice 2012 - od genomu po chleba

ISBN

978-80-7427-122-9

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

4

Pages from-to

107-110

Publisher name

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v. v. i.

Place of publication

Praha

Event location

VÚRV Praha-Ruzyně

Event date

Jan 1, 2012

Type of event by nationality

CST - Celostátní akce

UT code for WoS article

—