C-type Lectine protein of African swine fever virus
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F22%3A43880274" target="_blank" >RIV/62157124:16170/22:43880274 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
C-type Lectine protein viru Afrického moru prasat
Original language description
Virus afrického moru prasat, rod Asfivirus z čeledi Asfarviridae, je cytoplazmatický, lineární, obalený dsDNA virus přenášený vektorem, který postihuje všechny členy čeledi Suideae. K prevenci infekce zatím neexistuje vakcína, částečně v důsledku neznámé funkce většiny virových proteinů. C-type lectin protein je jedním z kandidátů na proteiny s imunogenní funkcí. Cílem práce byla identifikace antigenních oblastí ve struktuře C-type lectin proteinu a to porovnáním in-silico a pepscan analýzy tohoto proteinu. Oblasti proteinu s antigenními vlastnostmi byly identifikovány in silico analýzou (programem dostupným v Immune Epitope Database). Dále byly navrženy a nasyntetizovány peptidy pokrývající celou délku C-type lectin proteinu. Jejich sérologická reaktivita byla testována na souboru sér prasat pozitivních na virus afrického moru prasat. Korelace mezi in-silico identifikovánými B-buněčnými epitopy a syntetickými peptidy byla identifikována u většiny peptidů. Byly zjištěny domény obsahující potenciální B-buněčné epitopy ve struktuře C-type lectin proteinu. Dle našich experimentů se C-type lectin protein zdá být vhodným kandidátem nejen na protein s významem v sérologické diagnostice viru, ale i na subjednotkovou vakcínu proti Africkému moru prasat.
Czech name
C-type Lectine protein viru Afrického moru prasat
Czech description
Virus afrického moru prasat, rod Asfivirus z čeledi Asfarviridae, je cytoplazmatický, lineární, obalený dsDNA virus přenášený vektorem, který postihuje všechny členy čeledi Suideae. K prevenci infekce zatím neexistuje vakcína, částečně v důsledku neznámé funkce většiny virových proteinů. C-type lectin protein je jedním z kandidátů na proteiny s imunogenní funkcí. Cílem práce byla identifikace antigenních oblastí ve struktuře C-type lectin proteinu a to porovnáním in-silico a pepscan analýzy tohoto proteinu. Oblasti proteinu s antigenními vlastnostmi byly identifikovány in silico analýzou (programem dostupným v Immune Epitope Database). Dále byly navrženy a nasyntetizovány peptidy pokrývající celou délku C-type lectin proteinu. Jejich sérologická reaktivita byla testována na souboru sér prasat pozitivních na virus afrického moru prasat. Korelace mezi in-silico identifikovánými B-buněčnými epitopy a syntetickými peptidy byla identifikována u většiny peptidů. Byly zjištěny domény obsahující potenciální B-buněčné epitopy ve struktuře C-type lectin proteinu. Dle našich experimentů se C-type lectin protein zdá být vhodným kandidátem nejen na protein s významem v sérologické diagnostice viru, ale i na subjednotkovou vakcínu proti Africkému moru prasat.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
40301 - Veterinary science
Result continuities
Project
—
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2022
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů