Species-specific identification of bacteria genus Enterococcus spp. by PCR method

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F04%3A00000166" target="_blank" >RIV/62157124:16270/04:00000166 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Druhová identifikace bakterií rodu Enterococcus metodou PCR

Original language description

Cílem práce bylo zavést a optimalizovat druhově specifickou metodu PCR založenou na použití primerů detekujících přítomnost genů kódujících D-alanin:D-alanin ligázu druhů Enterococcus faecalis (ddlE. faecalis) a Enterococcus faecium (ddlE. faecium). Reakce byla koncipována jako multiplex-PCR, kdy mimo detekce druhově specifických genů ddl byla zařazena i interní kontrola (úsek 16S rRNA genu). Izolace DNA byla provedena lýzou suspenze bakteriálních buněk varem. Specifita PCR byla ověřena pomocí 16 sbírkových kmenů Gram-pozitivních, včetně 8 druhů enterokoků, a 3 kmenů Gram-negativních mikroorganismů. Celkem bylo vyšetřeno 69 kmenů Enterococcus faecalis, 30 kmenů Enterococcus faecium a 21 kmenů dalších druhů enterokoků (E. durans, E. hirae, E. mundtii, E. casseliflavus, E. malodoratus). Přítomnost druhově specifického ddl-genu byla prokázána u všech E. faecalis a E. faecium. Metoda PCR se osvědčila jako vhodná pro druhovou identifikaci bakterií Enterococcus faecalis a Enterococcus faeciu

Czech name

Druhová identifikace bakterií rodu Enterococcus metodou PCR

Czech description

Cílem práce bylo zavést a optimalizovat druhově specifickou metodu PCR založenou na použití primerů detekujících přítomnost genů kódujících D-alanin:D-alanin ligázu druhů Enterococcus faecalis (ddlE. faecalis) a Enterococcus faecium (ddlE. faecium). Reakce byla koncipována jako multiplex-PCR, kdy mimo detekce druhově specifických genů ddl byla zařazena i interní kontrola (úsek 16S rRNA genu). Izolace DNA byla provedena lýzou suspenze bakteriálních buněk varem. Specifita PCR byla ověřena pomocí 16 sbírkových kmenů Gram-pozitivních, včetně 8 druhů enterokoků, a 3 kmenů Gram-negativních mikroorganismů. Celkem bylo vyšetřeno 69 kmenů Enterococcus faecalis, 30 kmenů Enterococcus faecium a 21 kmenů dalších druhů enterokoků (E. durans, E. hirae, E. mundtii, E. casseliflavus, E. malodoratus). Přítomnost druhově specifického ddl-genu byla prokázána u všech E. faecalis a E. faecium. Metoda PCR se osvědčila jako vhodná pro druhovou identifikaci bakterií Enterococcus faecalis a Enterococcus faeciu

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

GM - Food industry

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

23. kongres Československé společnosti mikrobiologické - Abstrakty. Příloha Bulletinu Československé společnosti mikrobiologické

ISBN

0009-0646

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

1

Pages from-to

141

Publisher name

Československá společnost mikrobiologická

Place of publication

Praha

Event location

Brno

Event date

Sep 6, 2004

Type of event by nationality

CST - Celostátní akce

UT code for WoS article

—