Multiplex detection and identification of important Clostridia species and genes responsible for the toxins production
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F24%3A43881214" target="_blank" >RIV/62157124:16270/24:43881214 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://hygiena-alimentorum.uvlf.sk/wp-content/uploads/zborniky/XLIV_RZPaPP.pdf" target="_blank" >https://hygiena-alimentorum.uvlf.sk/wp-content/uploads/zborniky/XLIV_RZPaPP.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Multiplexní detekce a identifikace významných druhů klostridií a genů zodpovědných za produkci jejich toxinů
Original language description
Klostridie jsou polyfyletickou třídou anaerobů, které jsou plodnými producenty toxinů. V této studii popisujeme multiplexní metodu qPCR pro detekci důležitých patogenů úzce souvisejících s alimentárními chorobami – Clostridium perfringens, Clostridioides difficile, Clostridium botulinum a genů odpovědných za produkci jejich hlavních toxinů (cpa, cpb, cpe, tcdA, tcdB , cdt, bontA, bontB, bontE a bontF). Byl stanoven limit detekce, diagnostická senzitivita a specificita. V rámci multiplexní qPCR nedošlo ke křížové detekci druhů a necílové bakterie nevytvářely falešně pozitivní výsledky. Jedinečnost systému spočívá v multiplexování různých vzorků, ale také ve vysoké citlivosti umožňující detekovat 10 kopií DNA na reakci nebo i méně. Metoda multiplexní qPCR nabízí rychlou, jednoduchou a přesnou identifikaci významných patogenů. Mohla by být použita při stanovení bezpečnosti potravin, v klinické diagnostice a pro sledování patogenů v epidemiologických studiích.
Czech name
Multiplexní detekce a identifikace významných druhů klostridií a genů zodpovědných za produkci jejich toxinů
Czech description
Klostridie jsou polyfyletickou třídou anaerobů, které jsou plodnými producenty toxinů. V této studii popisujeme multiplexní metodu qPCR pro detekci důležitých patogenů úzce souvisejících s alimentárními chorobami – Clostridium perfringens, Clostridioides difficile, Clostridium botulinum a genů odpovědných za produkci jejich hlavních toxinů (cpa, cpb, cpe, tcdA, tcdB , cdt, bontA, bontB, bontE a bontF). Byl stanoven limit detekce, diagnostická senzitivita a specificita. V rámci multiplexní qPCR nedošlo ke křížové detekci druhů a necílové bakterie nevytvářely falešně pozitivní výsledky. Jedinečnost systému spočívá v multiplexování různých vzorků, ale také ve vysoké citlivosti umožňující detekovat 10 kopií DNA na reakci nebo i méně. Metoda multiplexní qPCR nabízí rychlou, jednoduchou a přesnou identifikaci významných patogenů. Mohla by být použita při stanovení bezpečnosti potravin, v klinické diagnostice a pro sledování patogenů v epidemiologických studiích.
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
—
OECD FORD branch
40301 - Veterinary science
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK22010086" target="_blank" >QK22010086: Multiplex detection and identification of genes responsible for antimicrobial resistance and toxin production in important bacterial agent in foodstuffs</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2024
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
Hygiena Alimentorum XLIV.: Mäso a mäsové výrobky
ISBN
978-80-8077-822-4
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
8
Pages from-to
469-476
Publisher name
Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach
Place of publication
Košice
Event location
Štrbské Pleso
Event date
May 15, 2024
Type of event by nationality
EUR - Evropská akce
UT code for WoS article
—