Prototype of Kit for NSCLC Tumor Processing samples
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F63078180%3A_____%2F17%3AN0000001" target="_blank" >RIV/63078180:_____/17:N0000001 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.vuab.cz" target="_blank" >http://www.vuab.cz</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Prototyp kitu pro zpracování vzorků nádoru NSCLC
Original language description
Prototyp diagnostického kitu řady oncoNGS pro přípravu vzorků unikátním postupem multiplexní PCR pro optimalizaci léčby nádoru NSCLC (nemalobuněčného karcinomu plic) metodou sekvenování nové generace (NGS) na přístroji Illumina MiSeq®. Prototyp obsahuje potřebné reagencie pro přípravu knihovny vzorků metodou NGS, tj. reagenční mastermixy obsahující směs pro multiplexní PCR (pufr, nukleotidy, DNA polymerázu, hořečnaté ionty a další aditiva a stabilizátory), primermix se směsí specifických primerů pro amplifikaci specifických úseků DNA souvisejících s diagnostikou NSCLC. Dále primery s adaptorovými sekvencemi a indexy pro odlišení vzorků a sekvenační primery. Výchozím materiálem pro přípravu vzorku je DNA izolovaná z nativní nádorové tkáně, z FFPE, nebo z plazmy. Prototyp je založen na principu dvoukrokové amplifikace specifických úseků DNA, jejíž součástí je inkorporace adaptorových sekvencí a indexů odlišujících pacientské vzorky, a následné purifikace, nezbytné pro sekvenování na přístroji Miseq®. Data jsou analyzována pomocí vhodného software (není součástí prototypu) a hodnocena je přítomnost bodových mutací a dalších odchylek (inzerce, delece) od lidského referenčního genomu.
Czech name
Prototyp kitu pro zpracování vzorků nádoru NSCLC
Czech description
Prototyp diagnostického kitu řady oncoNGS pro přípravu vzorků unikátním postupem multiplexní PCR pro optimalizaci léčby nádoru NSCLC (nemalobuněčného karcinomu plic) metodou sekvenování nové generace (NGS) na přístroji Illumina MiSeq®. Prototyp obsahuje potřebné reagencie pro přípravu knihovny vzorků metodou NGS, tj. reagenční mastermixy obsahující směs pro multiplexní PCR (pufr, nukleotidy, DNA polymerázu, hořečnaté ionty a další aditiva a stabilizátory), primermix se směsí specifických primerů pro amplifikaci specifických úseků DNA souvisejících s diagnostikou NSCLC. Dále primery s adaptorovými sekvencemi a indexy pro odlišení vzorků a sekvenační primery. Výchozím materiálem pro přípravu vzorku je DNA izolovaná z nativní nádorové tkáně, z FFPE, nebo z plazmy. Prototyp je založen na principu dvoukrokové amplifikace specifických úseků DNA, jejíž součástí je inkorporace adaptorových sekvencí a indexů odlišujících pacientské vzorky, a následné purifikace, nezbytné pro sekvenování na přístroji Miseq®. Data jsou analyzována pomocí vhodného software (není součástí prototypu) a hodnocena je přítomnost bodových mutací a dalších odchylek (inzerce, delece) od lidského referenčního genomu.
Classification
Type
G<sub>prot</sub> - Prototype
CEP classification
—
OECD FORD branch
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
Result continuities
Project
<a href="/en/project/TA04010838" target="_blank" >TA04010838: Diagnostics of cancer with Next Generation Sequencing</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2017
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data specific for result type
Internal product ID
TA04010838V001
Numerical identification
2014TA04010838
Technical parameters
Parametry přesnosti - opakovatelnost a reprodukovatelnost - kvalitativní hodnocení - vyhovuje Citlivost pro detekci nalezených mutací 5%. Předběžné hodnocení funkční způsobilosti provedeno na 24 vzorcích ze zdravotnického terénu. Vypočtena diagnostická citlivost a specifita vyšší než 90%.
Economical parameters
Ekonomickými přínosy z využití výsledku budou zejména tržby z prodeje, získání nových zákazníků (noví zákazníci v oblasti NGS technologií a diagnostiky), postupné zvyšování zisku z prodeje výrobků při navýšení počtu vyrobených kitů v jedné šarži. V rámci marketingové studie byla zmapována rovněž konkurence v České republice a zahraničí a konstatována přidaná hodnota vyvinutých produktů, která umožnila reálné nastavení ceny produktu. Uzavřením spolupráce s výrobcem izolačních souprav je plánován prodej komplexního řešení přípravy vzorku pro NGS, které zvýší konkurenceschopnost výrobků obou společností.
Application category by cost
—
Owner IČO
63078180
Owner name
VUAB Pharma a.s.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
V - Výsledek je využíván vlastníkem
Licence fee requirement
—
Web page
www.vuab.cz