Kit for the preparation of genetic library of colorectal cancer samples for NGS technology
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F63078180%3A_____%2F17%3AN0000002" target="_blank" >RIV/63078180:_____/17:N0000002 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.vuab.cz" target="_blank" >http://www.vuab.cz</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Prototyp kitu pro zpracování vzorků nádoru kolorekta
Original language description
Prototyp diagnostického kitu řady oncoNGS pro přípravu vzorků unikátním postupem multiplexní PCR pro optimalizaci léčby nádoru kolorekta metodou sekvenování nové generace (NGS) na přístoji Illumina Miseq obsahuje potřebné reagencie pro přípravu knihovny vzorků metodou NGS, tj. reagenční mastermixy obsahující směs pro multiplexní PCR (pufr, nukleotidy, DNA polymerázu, hořečnaté ionty a další aditiva a stabilizátory), primermix se směsí specifických primerů pro amplifikaci specifických úseků DNA souvisejících s diagnostikou kolorektálního karcinomu, dále primery s adaptorovými sekvencemi, indexy pro rozlišení vzorků a sekvenační primery. Výchozím materiálem pro přípravu vzorků je DNA izolovaná z nativní nádorové tkáně, nebo FFPE (parafinem fixovaných nádorových tkání). Prototyp umožňuje připravit knihovnu vzorků, která je po purifikaci vhodná pro sekvenování na přístroji Miseq.
Czech name
Prototyp kitu pro zpracování vzorků nádoru kolorekta
Czech description
Prototyp diagnostického kitu řady oncoNGS pro přípravu vzorků unikátním postupem multiplexní PCR pro optimalizaci léčby nádoru kolorekta metodou sekvenování nové generace (NGS) na přístoji Illumina Miseq obsahuje potřebné reagencie pro přípravu knihovny vzorků metodou NGS, tj. reagenční mastermixy obsahující směs pro multiplexní PCR (pufr, nukleotidy, DNA polymerázu, hořečnaté ionty a další aditiva a stabilizátory), primermix se směsí specifických primerů pro amplifikaci specifických úseků DNA souvisejících s diagnostikou kolorektálního karcinomu, dále primery s adaptorovými sekvencemi, indexy pro rozlišení vzorků a sekvenační primery. Výchozím materiálem pro přípravu vzorků je DNA izolovaná z nativní nádorové tkáně, nebo FFPE (parafinem fixovaných nádorových tkání). Prototyp umožňuje připravit knihovnu vzorků, která je po purifikaci vhodná pro sekvenování na přístroji Miseq.
Classification
Type
G<sub>prot</sub> - Prototype
CEP classification
—
OECD FORD branch
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
Result continuities
Project
<a href="/en/project/TA04010838" target="_blank" >TA04010838: Diagnostics of cancer with Next Generation Sequencing</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2017
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data specific for result type
Internal product ID
TA04010838V002
Numerical identification
2014TA04010838
Technical parameters
Parametry přesnosti - opakovatelnost a reprodukovatelnost - kvalitativní hodnocení - vyhovuje Citlivost pro detekci nalezených mutací 5%. Předběžné hodnocení funkční způsobilosti provedeno v Laboratoři molekulární patologie VFN byla provedena na 46 vzorcích ze zdravotnického terénu, shoda ve 43 vzorcích. Vypočtena diagnostická citlivost a specifita vyšší než 92%.
Economical parameters
Tržby z prodeje, získání nových zákazníků v oblasti NGS technologií a diagnostiky, postupné zvyšování zisku z prodeje výrobků při navýšení velikosti šarží vyrobených kitů.
Application category by cost
—
Owner IČO
63078180
Owner name
VUAB Pharma a.s.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
V - Výsledek je využíván vlastníkem
Licence fee requirement
—
Web page
www.vuab.cz