LinkMRC - user software for optimalized composition of consecutive stacks of images from confocal microscope
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985823%3A_____%2F08%3A00308637" target="_blank" >RIV/67985823:_____/08:00308637 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
LinkMRC - user software for optimalized composition of consecutive stacks of images from confocal microscope
Original language description
LinkMRC is a program for composing two series of consecutive thick optical sections captured by a Bio-Rad confocal microscope. Input is represented by two files in native format and output by one file containing series of confocal images composed from the two input series, one above the other and aligned by rotation and translation. The alignment of consecutive sections is refined by automatic algorithms based either on minimalization of the sum of absolute valued differences between the consecutive images from two sections, or on maximalization of normalized correlation coefficient or mutual information function between the consecutive parts of sections
Czech name
LinkMRC - program pro optimalizované skládání následně snímaných serií obrazů z konfokálního mikroskopu
Czech description
LinkMRC je program pro skládání dvou následných serií optických řezů získaných konfokálním mikrosopem Bio-Rad. Jako vstup slouží dva soubory v nativním formátu konfokálního mikroskopu a výsledkem je jeden soubor z nich složený. Optimalizace navázání řezůvyužívá automatické algoritmy založené na minimalizaci absolutních hodnot rozdílu mezi následujícími vrstvami řezů nebo maximalizaci normalizovaného korelačního koeficientu, příp. vzájemné informační funkce mezi následujícími vrstvami serií
Classification
Type
X - Unclassified
CEP classification
JC - Computer hardware and software
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů