A Plan 9 port of MrBayes: a program for Bayesian inference of phylogeny using Markov Chain Monte Carlo methods
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985831%3A_____%2F03%3A00043959" target="_blank" >RIV/67985831:_____/03:00043959 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
A Plan 9 port of MrBayes: a program for Bayesian inference of phylogeny using Markov Chain Monte Carlo methods
Original language description
MrBayes is a program for Bayesian inference of phylogeny using Markov Chain Monte Carlo methods. MrBayes has a console interface and uses a modified NEXUS format for data and batch files. It handles a wide range of probabilistic models for the evolutionof nucleotide and aminoacid sequences, restriction sites, and standard binary data. The user can set the priors used for the parameters and search for trees under topological constraints. The behavior of the Markov chain can be controlled by setting proposal probabilities for different move types and by invoking heated chains (Metropolis Coupling) to improve performance for difficult problems. Various options are available for summarizing the posterior distribution of the model parameters, including topology and branch lengths, and drawing inferences about ancestral states and site rates. The program is authored by John P. Huelsenbeck (Dept. Biology, University of Rochester) and Fredrik Ronquist (Evolutionary Biology Centre, Uppsala ...
Czech name
MrBayes pro Plan 9: program pro fylogenetickou inferenci využívající MCMC metody
Czech description
Mr Bayes pro Plan 9 je program pro fylogenetickou inferenci využívající MCMC metody. Operační systém Plan 9 vznikl v Bellových labotatořích. Je to progresívní distribuovaná výpočetní platforma vzniklá znovunavržením UNIXu, vhodná pro výzkumné programy. Port pod operační systém Plan 9 je předkládán veřejnosti k volnému šíření, aby byl podpořen zájem zejména programátorů a biologů o platformu Plan 9.
Classification
Type
X - Unclassified
CEP classification
EG - Zoology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/KSK6005114" target="_blank" >KSK6005114: Biodiversity and functions of ecological systems</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2003
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů