DNA adducts of the enantiomers of the Pt(II) complexes of the ahaz ligand (ahaz=3-aminohexahydroazepine) and recognition of these adducts by HMG domain proteins
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F05%3A00001321" target="_blank" >RIV/68081707:_____/05:00001321 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
DNA adducts of the enantiomers of the Pt(II) complexes of the ahaz ligand (ahaz=3-aminohexahydroazepine) and recognition of these adducts by HMG domain proteins
Original language description
The bending, unwinding, and structural changes in DNA caused by the binding of each of the enantiomers of the platinum(II) complexes of the ahaz ligand (R- and S-[PtCl2(ahaz)], ahaz 3-aminohexahydroazepine) have been studied using 20-23 bp oligonucleotides containing TGGT and CGGA-binding sites as has the recognition of the adducts by HMG domain proteins. The domain A of HMGB1 (HMGB1a protein) binds to the adduct formed by the R enantiomer at the CGGA sequence with a similar high affinity as it does tothe adduct of antitumor cisplatin, and to the adduct formed by the S enantiomer with a slightly lower affinity. In contrast, HMGB1a binds much more weakly to the ahaz adducts than to the cisplatin adducts formed at the TGGT sequence, with the binding tothe adduct formed by the R enantiomer being weakest. Each enantiomer and cisplatin cause unwinding of both sequences that is in the narrow range, 19-22 degrees.
Czech name
Adukty vytvořené v DNA enantiomerními platnatými komplexy obsahujícími ligand ahaz (ahaz=3-aminohexahydroazepin) a rozlišení těchto aduktů proteiny obsahujícími doménu HMG
Czech description
Ohnutí, rozvinutí a další strukturní změny v DNA vyvolané vazbou enantiomerů platnatých komplexů obsahujících ligand ahaz (ahaz=3-aminohexahydroazepin) byly studovány s využitím krátkých duplexů DNA 20-23 párů bází dlouhých obsahujících vazebná místa TGGT a CGGA pro rozlišení aduktů proteiny obsahujícími doménu HMG. Strukturní studie spolu s počítačovým modelováním odhalily výrazné odlišnosti v lokálních distorsích ve vazebných místech obsahujících GG sekvence a ukazují, že interakce mezi methylovými skupinami a ligandem ahaz pravděpodobně inhibují ohnutí DNA v TGGT sekvenci.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
BO - Biophysics
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2005
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Biochemical and Biophysical Research Communications
ISSN
0006-291X
e-ISSN
—
Volume of the periodical
332
Issue of the periodical within the volume
4
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
8
Pages from-to
1034-1041
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—