Cytochrome b phylogeography of chamois (Rupicapra spp.). Population contractions, expansions and hybridizations governed the diversification of the genus

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081766%3A_____%2F09%3A00311960" target="_blank" >RIV/68081766:_____/09:00311960 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Cytochrome b phylogeography of chamois (Rupicapra spp.). Population contractions, expansions and hybridizations governed the diversification of the genus

Original language description

The chamois provides an excellent model for exploring the effect of historical and evolutionary events on diversification. We investigate cytochrome b (cytb) sequences in the 10 recognized subspecies of Rupicapra classified within 2 species: Rupicapra pyrenaica, with the subspecies parva, pyrenaica, and ornata, and Rupicapra rupicapra, with cartusiana, rupicapra, tatrica, carpatica, balcanica, asiatica, and caucasica. A fragment of 349 bp of the cytb was sequenced in 189 individuals. We identified 3 cytb lineages: Clade West in Iberia and Western Alps; Clade Central in the Apennines and the Massif of Chartreuse; and Clade East present in populations to the east of the Alps. The 2 proposed species were polyphyletic; the clades West and Central are represented in both, whereas the Clade East is restricted to R. rupicapra. In contrast to the current systematic, cytb phylogenies suggest the classification of the 10 subspecies of chamois into a single species, R. rupicapra.

Czech name

Cytochrom b fylogeografie kamzíků (Rupicapra spp.). Kontrakce a expanze populací a hybridizace vedly k diverzifikaci rodu

Czech description

Kamzík je vhodným modelem pro zjišťování efektu historických a evolučních jevů na diverzifikaci. Zkoumáme sekvence cytochromu b (cytb) u 10 poddruhů rodu Rupicapra klasifikovaných do 2 druhů: Rupicapra pyrenaica s poddruhy parva, pyrenaica a ornata a Rupicapra rupicapra s poddruhy cartusiana, rupicapra, tatrica, carpatica, balcanica, asiatica a caucasica. Fragment genu pro cytb dlouhý 349 bp byl osekvenován u 189 jedinců. Identifikovali jsme 3 cytb linie: západní v Iberii a Západních Alpách, centrální vApeninách a Massif of Chartreuse a východní u populací nacházejících se východně od Alp. Oba předpokládané druhy jsou polyfyletické, přičemž západní a centrální linie je zastoupena u obou druhů a východní jen u R. rupicapra. Fylogeneze a geografická distribuce linií ukazuje, že omezené rozšiřování a kontrakce areálu a hybridizace mezi hluboce divergentními liniemi, spolu s vlivem ledovců v Alpách a Pyrenejích jako bariér toku genů, hrály významnou roli v diverzifikaci taxonů.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/IAA600930609" target="_blank" >IAA600930609: Genetic structure of chamois populations in Central Europe</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2009

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal of Heredity

ISSN

0022-1503

e-ISSN

—

Volume of the periodical

100

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

9

Pages from-to

—

UT code for WoS article

000261901400006

EID of the result in the Scopus database

—