A genome-wide association study identifies colorectal cancer susceptibility loci on chromosomes 10p14 and 8q23.3
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378041%3A_____%2F08%3A00306557" target="_blank" >RIV/68378041:_____/08:00306557 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
A genome-wide association study identifies colorectal cancer susceptibility loci on chromosomes 10p14 and 8q23.3
Original language description
To identify colorectal cancer (CRC) susceptibility alleles, we conducted a genome-wide association study. In phase 1 we genotyped 550 163 tagSNPs in 940 familial colorectal tumor cases and 965 controls. In phase 2 we genotyped 42,708 selected SNPs in 2,873 CRC cases and 2,871 controls. In phase 3 we evaluated 11 SNPs showing association at P < 10(-4) in a joint analysis of phases 1 and 2 in 4,287 CRC cases and 3,743 controls.
Czech name
Celogenomová asociační studie analyzujíci lokusy na chromozomu 10p14 a 8q23.3. ve vztahu k náchylnosti na vznik kolorektálního karcinomu
Czech description
Za účelem identifikace alel asociovaných s rizikem vzniku kolorektálního karcinomu (CRC), byla provedená celogenomová studie. V první fázi bylo analyzováno 550 163 SNPs u 940 pacientů s familiární formou CRC a u 965 kontrolních jedinců. V druhé fázi jsmeanalyzovali 42 708 vybraných SNPs u 2 873 CRC pacientů a 2 871 kontrol. Třetí fáze byla zaměřena už pouze na 11 vybraných SNPs prokazujících vysokou asociaci na hladině signifikance P < 10(-4) u 4 287 CRC pacientů a 3 743 kontrol.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA310%2F07%2F1430" target="_blank" >GA310/07/1430: Molecular and genetic characteristics of sporadic colorectal cancer in the Czech Republic.</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Nature Genetics
ISSN
1061-4036
e-ISSN
—
Volume of the periodical
40
Issue of the periodical within the volume
5
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
8
Pages from-to
623-630
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—