An alternative strategy for bacterial ribosome synthesis: Bacillus subtilis rRNA transcription regulation

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F04%3A00105280" target="_blank" >RIV/68378050:_____/04:00105280 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

An alternative strategy for bacterial ribosome synthesis: Bacillus subtilis rRNA transcription regulation

Original language description

As an approach to the study of rRNA synthesis in Gram-positive bacteria, we characterized the regulation of the Bacillus subtilis rrnB and rrnO rRNA promoters. We conclude that B. subtilis and Escherichia coli use different strategies to control rRNA synthesis. In contrast to E. coli, it appears that the initiating NTP for transcription from B. subtilis rRNA promoters is GTP, promoter strength is determined primarily by the core promoter (-10/-35 region), and changes in promoter activity always correlate with changes in the intracellular GTP concentration. rRNA promoters in B. subtilis appear to be regulated by changes in the initiating NTP pools, but in some growth transitions, changes in rRNA promoter activity are also dependent on relA, which codesfor ppGpp synthetase. In contrast to the situation for E. coli where ppGpp decreases rRNA promoter activity by directly inhibiting RNA polymerase, it appears that ppGpp may not inhibit B. subtilis RNA polymerase directly. Rather, incre...

Czech name

Alternativní strategie syntézy bakteriálních ribozomů: regulace transkripce rRNA u Bacillus subtilis

Czech description

Jako postup studia syntézy rRNA v Gram-pozitivních bakteriích jsme zvolili charakterizaci regulace rRNA promotorů rrnB a rrnO u Bacillus subtilis. Vyvodili jsme, že B. subtilis a Escherichia coli využívají k regulaci syntézy rRNA odlišnou strategii. Na rozdíl od E. coli je zřejmě iniciačním NTP pro transkripci u B. subtilis rRNA promotorů GTP, síla promotoru je primárně určena jádrem promotoru (oblast -10/-35) a změny promotorové aktivity vždy odpovídají změnám v intracelulární koncentraci GTP. rRNA promotory u B. subtilis jsou zřejmě regulovány změnami zásob iniciačního NTP, ale u některých růstových přechodů závisejí změny aktivity rRNA promotorů na relA, který kóduje ppGpp syntetázu. Oproti situaci u E. coli, kde ppGpp snižuje aktivitu rRNA promotorů přímou inhibicí RNA polymerázy, ppGpp zřejmě nemůže inhibovat RNA polymerázu B. subtilis přímo. Zdá se spíše, že koncentrace ppGpp snižuje dostupné zásoby GTP a tím moduluje aktivitu rRNA promotorů nepřímo

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

EMBO Journal

ISSN

0261-4189

e-ISSN

—

Volume of the periodical

23

Issue of the periodical within the volume

22

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

11

Pages from-to

4473-4483

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—