The identity of the transcription +1 position is crucial for changes in gene expression in response to amino acid starvation in Bacillus subtilis

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F08%3A00310258" target="_blank" >RIV/61388971:_____/08:00310258 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/68378050:_____/08:00310258 RIV/61388963:_____/08:00310258 RIV/00216208:11110/08:1891

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

The identity of the transcription +1 position is crucial for changes in gene expression in response to amino acid starvation in Bacillus subtilis

Original language description

We identify here a pattern in the transcription start sites (+1A or +1G) of A- dependent promoters of genes that are up-/down-regulated in response to amino acid starvation (stringent response) in Bacillus subtilis. Upregulated promoters initiate mostlywith ATP and downregulated promoters with GTP. These promoters appear to be sensitive to changes in initiating NTP concentrations. During the stringent response in B. subtilis, when ATP and GTP levels change reciprocally, the identity of the +1 position(A or G) of these promoters is a factor important in their regulation. Mutations that change the identity of position +1 (A for G and vice versa) change the response of the promoter to amino acid starvation.

Czech name

Identita transkripční pozice +1 je klíčová pro změny genové exprese při odpovědi na aminokyselinové hladovění u Bacillus subtilis

Czech description

Identifikovali jsme nenáhodné rozložení transkripčních startů (+1A nebo +1G) A-závislých promotorů pro geny, jejichž exprese je buď zvýšena nebo snížena při hladovění po aminokyselinách (tzv. stringentní odpověď) u Bacillus subtilis. Promotory pro geny,jejichž exprese se zvýší, iniciují většinou ATP a promotory pro geny, jejichž exprese se sníží, iniciují GTP. Všechny tyto promotory se jeví jako senzitivní vůči změnám koncentrací iniciačních NTP. V průběhu stringentní odpovědi u B. subtilis, kdy dochází k současné, opačné změně koncentrací ATP a GTP, je identita pozice +1 (A nebo G) těchto promotorů faktorem důležitým pro jejich regulaci. Mutace, které mění identitu této pozice (A za G a naopak) mění i odpověď promotoru na aminokyselinové hladovění.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Molecular Microbiology

ISSN

0950-382X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

69

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

13

Pages from-to

42-54

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—