Chlorocatechol catabolic enzymes from Achromobacter xylosoxidans A8

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F04%3A00105345" target="_blank" >RIV/68378050:_____/04:00105345 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60461373:22330/04:00021244

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Chlorocatechol catabolic enzymes from Achromobacter xylosoxidans A8

Original language description

Achromobacter xylosoxidans strain A8, isolated from soil contaminated with polychlorinated biphenyls (PCBs), is able to use 2-clorobenzoate (2-CB) and 2,5-dichlorobenzoate (2,5-DCB) as sole sources of carbon and energy. The genome of this strain containstwo large conjugative plasmids pA81 and pA82. A cluster of genes homologous to genes of a modified ortho-cleavage pathway was identified on the 12.4 kbp fragment of pA81. The genes, mocpR-ABCD, are highly homologous to the cbnR-ABXCD genes on plasmid pENH91 from Ralstonia eutropha ENH91, the tetR-CDXEF genes from Pseudomonas chlororaphis RW71 and tcbR-CDXEF genes identified on plasmid pP51 from Pseudomonas sp. strain P51. The structures of mocp, cbn, tet and tcb gene clusters are completely conserved in these bacteria. However, the sequences flanking the mocp genes differ from the sequence surrounding the tcb genes. A gene for IS1600 transposase, found on the ends of cbn genes, was identified only downstream from the mocp genes. The...

Czech name

Katabolické enzymy chlorokatecholů z Achromobacter xylosoxidans A8

Czech description

Kmen Achromobacter xylosoxidans A8 izolovaný z půdy kontaminované polychlorovanými bifenyly (PCB) je schopen využit jako jediné zdroje uhlíku a energie 2-chlorbenzoát (2-CB) a 2,5-dichlorbenzoát (2,5-DCB). Genom tohoto kmene obsahuje dva velké kojugativní plasmidy pA81 a pA82. Na fragmentu velikosti 12,4 kbp pA81 byl identifikován shluk genů homologních s geny modifikované dráhy štěpení v pozici ortho-. Tyto geny, mocpR-ABCD, jsou vysoce homologní s geny cbnR-ABXCD na plasmidu pENH91 z Ralstonia eutropha ENH91, geny tetR-CDXEF z Pseudomonas chlororaphis RW71 a geny tcbR-CDXEF identifikovanými na plasmidu pP51 z Pseudomonas sp. kmene P51. Struktura shluku genů mocp, cbn, tet a tcb je v těchto bakteriích vysoce konzervována. Sekvence sousedící s geny mocp se však liší se sekvencemi sousedícími s geny tcb. Gen pro transpozázu IS1600 nalezený na koncích genů cbn byl identifikován pouze po směru transkripce od genů mocp. Okolí genu pro transpozázu a umístění genů mocp na konjugativním pl...

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LN00A079" target="_blank" >LN00A079: Center of Integrated Genomics</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

International Biodeterioration & Biodegradation

ISSN

0964-8305

e-ISSN

—

Volume of the periodical

54

Issue of the periodical within the volume

-

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

7

Pages from-to

175-181

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—