Monoclonal antibodies specific for the empty conformation of HLA-DR1 reveal aspects of the conformational change associated with peptide binding

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F04%3A00105351" target="_blank" >RIV/68378050:_____/04:00105351 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Monoclonal antibodies specific for the empty conformation of HLA-DR1 reveal aspects of the conformational change associated with peptide binding

Original language description

Class II major histocompatibility complex (MHC) proteins bind peptides and present them at the cell surface for interaction with CD4+ T cells as part of the system by which the immune system surveys the body for signs of infection. Peptide binding is known to induce conformational changes in class II MHC proteins on the basis of a variety of hydrodynamic and spectroscopic approaches, but the changes have not been clearly localized within the overall class II MHC structure. To map the peptide-induced conformational change for HLA-DR1, a common human class II MHC variant, we generated a series of monoclonal antibodies recognizing the beta subunit that are specific for the empty conformation. Each antibody reacted with the empty but not the peptide-loadedform, for both soluble recombinant protein and native protein expressed at the cell surface. Antibody binding epitopes were characterized using overlapping peptides and alanine scanning substitutions and were localized to two distinct...

Czech name

Monoklonální protilátky specifické pro prázdnou konformaci HLA-DR1 ukazují aspekty konformační změny spojené s vazbou peptidů

Czech description

Proteiny hlavního histokompatibilitního systému 2. třídy vážou peptidy a prezentují je na buněčném povrchu, aby mohly reagovat s CD4+ T buňkami jako součást systému, kterým imunitní systém kontroluje příznaky infekce v těle. Na základě různých hydrodynamických a spektroskopických postupů bylo zjištěno, že vazba peptidů vyvolává konformační změny u proteinů MHC 2. třídy, ale tyto změny nebyly v rámci celkové struktury MHC 2. třídy jasně lokalizovány. Abychom zmapovali konformační změnu HLA-DR1, známé varianty MHC 2. třídy, vyvolanou peptidy, připravili jsme sérii monoklonálních protilátek rozpoznávajících podjednotku beta, která je specifická pro prázdnou konformaci. Každá protilátka reagovala s prázdnou formou, ale ne s formou obsazenou peptidem, protože jak rozpustný rekombinantní protein, tak nativní protein byly exprimovány na buněčném povrchu. Epitopy vázající protilátky byly charakterizovány pomocí překrývajících se peptidů a hledání nahrazených alaninů a byly lokalizovány do ...

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EC - Immunology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LN00A026" target="_blank" >LN00A026: Center of molecular and cellular immunology</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal of Biological Chemistry

ISSN

—

e-ISSN

—

Volume of the periodical

279

Issue of the periodical within the volume

16

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

9

Pages from-to

16561-16570

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—