Retroposition of processed pseudogenes: the impact of RNA stability and translational control

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F06%3A00029071" target="_blank" >RIV/68378050:_____/06:00029071 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Retroposition of processed pseudogenes: the impact of RNA stability and translational control

Original language description

Human processed pseudogenes are copies of cellular RNAs reverse transcribed and inserted into the nuclear genome by the enzymatic machinery of L1 (LINE1) non-LTR retrotransposons. Although it is generally accepted that germline expression is crucial forthe heritable retroposition of cellular mRNAs, little is known about the influences of RNA stability, mRNA quality control and compartmentalization of translation on the retroposition of processed pseudogenes. We found that frequently retroposed human mRNAs are derived from stable transcripts with translation-competent functional reading frames that are resistant to nonsense-mediated RNA decay. They are preferentially translated on free cytoplasmic ribosomes and encode soluble proteins. Our results indicate that interactions between mRNAs and L1 proteins seem to occur at free cytoplasmic ribosomes.

Czech name

Retropozice procesovaných pseudogenů: vliv stability RNA a translační kontroly

Czech description

Lidské procesované pseudogeny jsou kopie buněčných RNA, které jsou reverzně přepsány a vloženy do jaderného genomu pomocí enzymatické mašinérie L1 (LINE1) non-LTR retrotranspozónů. Je obecně přijímáno, že exprese v germinální linii je zásadní pro děditelnou retropozici buněčné mRNA. Málo je však známo o vlivu RNA stability, kontrole kvality mRNA a kompartmentalizaci translace na retropozici procesovaných pseudogenů. V článku popisujeme, že často retrotransponované lidské mRNA jsou odvozeny od stabilníchtranskriptů s translačně funkčními čtecími rámci, které jsou rezistentní k mechanismu odstraňování nekódující mRNA. Jsou preferenčně překládány na volných cytoplasmatických ribozomech a kódují rozpustné proteiny. Naše výsledky naznačují, že k interakcemezi mRNA a L1 proteiny dochází na volných cytoplasmatických ribozómech.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/1M0520" target="_blank" >1M0520: Center for Applied Genomics</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Trends in Genetics

ISSN

0168-9525

e-ISSN

—

Volume of the periodical

22

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS

Number of pages

5

Pages from-to

69-73

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—