Intracellular expression profiles measured by real-time PCR tomography in the Xenopus laevis oocyte

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F08%3A00094683" target="_blank" >RIV/68378050:_____/08:00094683 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00216208:11110/08:1892

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Intracellular expression profiles measured by real-time PCR tomography in the Xenopus laevis oocyte

Original language description

Real-time tomography is a novel quantitative method for measuring localized RNA-expression profiles within single cells. We show its usefulness by dissecting an X. laevis oocyte to slices along its animal?vegetal axis, extracting RNA and measuring levelsof 18 selected mRNAs by real-time RT-PCR. This identified 2 classes of mRNA, one preferentially located towards the animal, the other towards the vegetal pole. mRNAs in each group show comparable intracellular gradients, suggesting they are produced bysimilar mechanisms. Polarization is substantial, though not extreme,with ca 5% of vegetal gene mRNA molecules at the animal pole and ca 50% in the far most vegetal section. Most animal pole mRNAs were found in the 2nd section from the animal pole and inthe central section where the nucleus is located. mRNA expression profiles did not change after in vitro fertilization; we conclude that the post-fertilization cortical rotation has no detectable effect on intracellular mRNA gradients.

Czech name

Vnitrobuněčné expresní profily, měřené pomocí real-time PCR tomografie ve vajíčcích Xenopus laevis

Czech description

Real time tomografie je nová kvantitativní metoda pro měření lokalizovaných RNA-expresních profilů uvnitř jediné buňky. Demonstrujeme její použitelnost řezáním vajíček z X. laevis podél animálně-vegetativní osy, extrakcí RNA a měřením hladiny 18-ti vybraných mRNA pomocí real-time RT-PCR. To identifikovalo 2 skupiny mRNA, jednu přednostně lokalizovanou k animálnímu a druhou k vegetativnímu pólu. mRNA z obou skupin ukazují porovnatelné vnitrobuněčné gradienty, což může znamenat, že jsou produkovány podobným mechanismem. Polarizace je značná, avšak ne extrémní, přičemž okolo 5% vegetativních mRNA molekul je detekováno v animálních řezech a okolo 50% molekul v posledním vegetativním řezu. Většina animálních mRNA byla nalezena v druhých řezech od animálníhopólu a v centrálních řezech, což je oblast výskytu jádra. mRNA expresní profily se nezměnily po in vitro oplození a z toho odvozujeme, že kortikální rotace, která se objevuje po oplození, nemá žádný vliv na vnitrobuněčné mRNA gradienty.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/KJB500520601" target="_blank" >KJB500520601: Quantification and localization of maternal mRNAs in early development of Xenopus</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Nucleic Acids Research

ISSN

0305-1048

e-ISSN

—

Volume of the periodical

36

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

GB - UNITED KINGDOM

Number of pages

6

Pages from-to

—

UT code for WoS article

00025302160

EID of the result in the Scopus database

—