Antibody array analysis with label-based detection and resolution of protein size

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F09%3A00318349" target="_blank" >RIV/68378050:_____/09:00318349 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Antibody array analysis with label-based detection and resolution of protein size

Original language description

Proteins from different cellular compartments were labeled and separated by size exclusion chromatography into 20 fractions. The elution profiles were compiled to color maps across the size separation range (670-10kDa). A new solid phase designed for processing in microwell plates was developed to handle the large number of samples. Antibodies were bound to protein G-coupled microspheres surface-labeled with 300 combinations of four fluorescent dyes. Fluorescence from particle color codes and the protein label was measured by high speed flow cytometry. Cytoplasmic protein kinases, membrane proteins, cyclin-dependent kinases (cdks), cyclins and cdk-inhibitors, were analyzed; the results were compatible with their occurrence in complexes that vary with the cell cycle phase and subcellular localization. A two-dimensional platform extends the utility of antibody array analysis to studies of protein complexes.

Czech name

Analýza založená na mnohočetném protilátkovém souboru, detekci značením a rozlišení velikosti proteinů

Czech description

Proteiny různých velikostí byly fluorescenčně označeny a separovány gelovou filtrací do 20 frakcí. Eluční profily byly uspořádány do barevných map v celém separačním rozsahu (670-10 kDa). Byl vyvinut nový typ nosiče vhodný pro zpracování velkého počtu vzorků v mikrodestičkách. Protilátky byly navázány na mikrokuličky s proteinem G značené 300 kombinacemi 4 fluoroforů a detekovány vysokorychlostní průtokovou cytometrií. Byly analyzovány proteinkinasy, membránové proteiny, cykliny a cyklin-dependentní kinasy. Výsledky odpovídaly známým komplexům těchto proteinů a jejich subcelulární lokalizaci v závislosti na buněčném cykly. tato dvojrozměrná platforma je vhodná jako nová metoda pro studium proteinových komplexů.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2009

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Molecular and Cellular Proteomics

ISSN

1535-9484

e-ISSN

—

Volume of the periodical

8

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

CA - CANADA

Number of pages

13

Pages from-to

—

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—