E-photosynthesis: a comprehensive modeling approach to understand chlorophyll fluorescence transients and other complex dynamic features of photosynthesis in fluctuating light

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21220%2F07%3A02133023" target="_blank" >RIV/68407700:21220/07:02133023 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60076658:12640/07:00008328

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

E-photosynthesis: a comprehensive modeling approach to understand chlorophyll fluorescence transients and other complex dynamic features of photosynthesis in fluctuating light

Original language description

Understanding of the complex, non-linear dynamics of photosynthesis in fluctuating light requires novel-modeling approaches that involve not only the primary light and dark biochemical reactions, but also networks of regulatory interactions. This requirement exceeds the capacity of the existing molecular models that are typically reduced to describe a partial process, dynamics of a specific complex or its particular dynamic feature. We propose a concept of comprehensive model that would represent an internally consistent, integral framework combining information on the reduced models that led to its construction. This review explores approaches and tools that exist in engineering, mathematics, and in other domains of biology that can be used to developa comprehensive model of photosynthesis. Equally important, we investigated techniques by which one can rigorously reduce such a comprehensive model to models of low dimensionality, which preserve dynamic features of interest.

Czech name

E-photosynthesis: ucelený modelovací přístup k porozumění fluorescence chlorofylu a dalších komplexních dynamických vlastností fotosyntézy při proměnlivém světle

Czech description

Porozumění komplexní nelineární dynamice fotosyntézy při proměnných světelných podmínkách vyžaduje nové přístupy modelování, která zahrnují nejen primární světelné a temné biochemické reakce, ale také sítě regulačních vazeb. Tyto požadavky překračují možnosti stávajících molekulárních modelů, které jsou většinou redukované tak, aby popsaly jednotlivý proces, dynamiku specifického komplexu nebo jeho konkrétní dynamickou vlastnost. Navrhujeme koncept uceleného modelu, který by reprezentoval vnitřně konzistentní framework kombinující informace získané z redukovaných modelů, které vedly k jeho sestavení. Tento přehled prozkoumává přístupy a nástroje, které již existují v inženýrských vědách, matematice a biologii, které by byly nápomocné při vývoji uceleného modelu fotosyntézy. Dále jsme vyvinuli techniky, kterými je možné redukovat takovýto ucelený model v modely nižšího řádu, při zachování významných dynamických vlastností.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/1M0567" target="_blank" >1M0567: Centre for Applied Cybernetics</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Photosynthesis Research

ISSN

0166-8595

e-ISSN

—

Volume of the periodical

93

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

12

Pages from-to

223-234

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—