Compensation of the Light Attenuation with Depth of Images Captured by a Confocal Microscope Using a MRF Deformation Model and Graph Cuts

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21460%2F08%3A12148112" target="_blank" >RIV/68407700:21460/08:12148112 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Kompenzace útlumu jasu konfokálních obrazů s hloubkou s použitím řezů grafem a deformačního modelu založeným na Markovských náhodných polích

Original language description

Předmětem našeho studia jsou fluorescenční optické řezy, tj. 3D obrazy, získané laserovým rastrovacím konfokálním mikroskopem z biomedicínských preparátů. Intenzity pixelů optických řezů z hlubších vrstev preparátu jsou často menší (tmavší) než intenzityřezů z povrchových vrstev následkem absorpce a rozptylu, jak excitačního, tak emitovaného fluorescenčního světla. Problém řešíme aplikováním modelu využívající Markovská náhodná pole, který zahrnuje deformační model pro sledování struktur ve 3D obrazech, pro výpočet optického toku souborem optických řezů. Příslušný optimalizační problém řešíme pomocí řezů grafem (graph cuts). Intenzity optických řezů jsou poté odhadnuty na základě nalezeného optického toku. Výsledné intenzity pixelů jsou získány pomocílícování kumulativních histogramů originálních optických řezů a řezů odhadnutých pomocí optického toku.

Czech name

Kompenzace útlumu jasu konfokálních obrazů s hloubkou s použitím řezů grafem a deformačního modelu založeným na Markovských náhodných polích

Czech description

Předmětem našeho studia jsou fluorescenční optické řezy, tj. 3D obrazy, získané laserovým rastrovacím konfokálním mikroskopem z biomedicínských preparátů. Intenzity pixelů optických řezů z hlubších vrstev preparátu jsou často menší (tmavší) než intenzityřezů z povrchových vrstev následkem absorpce a rozptylu, jak excitačního, tak emitovaného fluorescenčního světla. Problém řešíme aplikováním modelu využívající Markovská náhodná pole, který zahrnuje deformační model pro sledování struktur ve 3D obrazech, pro výpočet optického toku souborem optických řezů. Příslušný optimalizační problém řešíme pomocí řezů grafem (graph cuts). Intenzity optických řezů jsou poté odhadnuty na základě nalezeného optického toku. Výsledné intenzity pixelů jsou získány pomocílícování kumulativních histogramů originálních optických řezů a řezů odhadnutých pomocí optického toku.

Type

R - Software

CEP classification

IN - Informatics

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

AttenCuts 1.0

Technical parameters

Softwarový systém určený pro PC

Economical parameters

—

Owner IČO

68407700

Owner name

České vysoké učení technické v Praze, Fakulta biomedicínského inž.