Detection and quantification of E. coli by quantitative polymerase chain reaction (qPCR)
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F75010330%3A_____%2F22%3A00014174" target="_blank" >RIV/75010330:_____/22:00014174 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://szu.cz/odborna-centra-a-pracoviste/centrum-zdravi-a-zivotniho-prostredi/ohv/projekty-oddeleni-hygieny-vody/vyuziti-metod-molekularni-biologie-k-identifikaci-zdroju-znecisteni-v-koupacich-vodach" target="_blank" >https://szu.cz/odborna-centra-a-pracoviste/centrum-zdravi-a-zivotniho-prostredi/ohv/projekty-oddeleni-hygieny-vody/vyuziti-metod-molekularni-biologie-k-identifikaci-zdroju-znecisteni-v-koupacich-vodach</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Stanovení E. coli metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce (qPCR)
Original language description
Jedná se molekulárně biologickou metodu stanovení E. coli z matrice koupací voda. Principem zkoušky je izolace DNA z uměle připravených nebo neznámých přírodních vzorků pomocí některého z komerčních kitů (např. PowerSoil (Qiagen), PowerWater (Qiagen) apod.) a následné mnohonásobné namnožení specifického úseku DNA (v našem případě části genu pro 16S rRNA) a detekce množství DNA vznikající v každém cyklu qPCR reakce. Detekce množství DNA je umožněno měřením hladiny fluorescence substrátu, který se váže na nově vznikající DNA úseky. Hladina fluorescence tedy odráží množství přítomné DNA.
Czech name
Stanovení E. coli metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce (qPCR)
Czech description
Jedná se molekulárně biologickou metodu stanovení E. coli z matrice koupací voda. Principem zkoušky je izolace DNA z uměle připravených nebo neznámých přírodních vzorků pomocí některého z komerčních kitů (např. PowerSoil (Qiagen), PowerWater (Qiagen) apod.) a následné mnohonásobné namnožení specifického úseku DNA (v našem případě části genu pro 16S rRNA) a detekce množství DNA vznikající v každém cyklu qPCR reakce. Detekce množství DNA je umožněno měřením hladiny fluorescence substrátu, který se váže na nově vznikající DNA úseky. Hladina fluorescence tedy odráží množství přítomné DNA.
Classification
Type
N<sub>metA</sub> - Methodology accredited and procedures by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/TJ04000132" target="_blank" >TJ04000132: The use of molecular biology for identification of bathing water contamination sources</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2022
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
SOP č. 48/1.1
Regulation ID
osvědčení o akreditaci č. 561/2022
Technical parameters
Stanovení E. coli z koupacích vod metodou qPCR. Metodika je vlastnictvím Státního zdravotního ústavu. S autory metodiky je možné metodiku konzultovat a nahlížet do ní.
Economical parameters
Rozšíření portfolia akreditovaných metod Oddělení hygieny vody SZÚ.
Certification body designation
Český institut pro akreditaci, o.p.s., Olšanská 54/3, 130 00 Praha 3
Date of certification
—
Method of use
A - Výsledek využívá pouze poskytovatel