Programovaná eliminace DNA: studium funkcí a mechanismů regulují proces v genomech živočichů s hemikonální dědičností
Cíle projektu
Stabilita genomu je pro organismy vysoce důležitá, zejména pro udržení přesně vyladěné funkčnosti jejich genomů. Avšak různá eukaryota realizují programované odstranění DNA, kdy se během individuálního vývoje ztrácí části či celé chromozomy. Ve většině případů je programovaná DNA eliminace spojena buď s diferenciací somatických buněk nebo určením pohlaví. Není však známo, jak k reprodukovatelnému zachování či odstranění segmentů genomu dochází. Navrhovaný projekt má za cíl analyzovat molekulární, chromozomální a genomové mechanismy k pochopení procesů, jakými se ztrácí celé genomy během programované eliminaci DNA. Srovnáním dat ze skupiny ryb (Hypseleotris) a čtyřnožců ( Pelophylax) s hemiklonální dědičností (hybridogeneze) očekáváme zásadní vhled do eliminujících procesů během jejich gametogeneze. Pochopení mechanismů, kterými obratlovci regulují takto rozsáhlé přestavby svého genomu, poskytne porozumění procesům zajišťující stabilitu a změnu v genomech obratlovců.
Klíčová slova
Genome eliminationHybridogenesisAsexual propagationHemicloneModified MeiosisGenomic In Situ Hybridization
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Hlavní účastníci
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
19-24559S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Programmed DNA elimination: on the functions and mechanisms regulating the process in animal genomes with hemiclonal heredity
Anotace anglicky
The stability of the genome is essential and paramount to organisms for maintaining the precisely tuned functionality of their genomes. However, diverse eukaryotes carry out programmed DNA elimination in which portions or entire chromosomes are lost during individual development. In most cases, programmed DNA elimination is associated with either differentiation of somatic cells or sex determination. How different genomic segments are reproducibly retained or discarded is unknown. The proposed project intends to analyze molecular, chromosomal and genomic mechanisms to understand processes how whole genomes will be lost during programmed DNA elimination. From the comparative approach with included one group of fish (Hypseleotris) and one group of tetrapods (Pelophylax) with a hemiclonal heredity (hybridogenesis) we expect fundamental insights into eliminating processes during gametogenesis. Understanding the mechanisms by which vertebrates regulate such extensive remodelling of its genome will provide insights into factors that can promote stability and change in vertebrate genomes.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10613 - Zoology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)EG - Zoologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2019
Ukončení řešení
30. 6. 2022
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
26. 6. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
4 492 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
4 330 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
162 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 492 tis. Kč
Statní podpora
4 330 tis. Kč
96%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Zoology
Doba řešení
01. 01. 2019 - 30. 06. 2022