Mapování chemodiverzity pepřovníkovitých rostlin pomocí nové generace platformy MZmine
Cíle projektu
Bioaktivní specializované metabolity z rostlin představují důležitý zdroj chemických struktur pro vývoj nových léčiv, ale pro plné využití tohoto přírodního zdroje nutně potřebujeme vyvinout nové technologické platformy. V tomto projektu rozšíříme populární metabolomickou platformu MZmine o nové moduly pro iontovou mobilitní spektrometrii a molekulární sítě, dvě nejmodernější techniky užívané pro efektivní izolaci a identifikaci různorodých přírodních látek. Dále vyvineme a ohodnotíme novou bioinformatickou metodu založenou na genetických sítích pro asociaci rostlinných metabolitů s jejich biosyntetickými enzymy. Pro demonstraci těchto technologických pokroků budeme mapovat chemodiverzitu čeledě pepřovníkovitých rostlin, která je známá jako mimořádně bohatý a nevyužitý rezervoár bioaktivních specializovaných metabolitů.
Klíčová slova
MZmineion mobility spectrometrymolecular networkinggenetic networkingPiperaceaeplant specialized metabolitesbiosynthetic pathways
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
JUNIOR STAR
Veřejná soutěž
SGA0202100006
Hlavní účastníci
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
21-11563M
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Mapping the chemodiversity of Piperaceae plants using next-generation MZmine platform
Anotace anglicky
Bioactive specialized metabolites from plants represent an essential source of chemical scaffolds for the development of new medicines, but new technological platforms are urgently needed to fully utilize this natural resource. In this project we will expand the capabilities of the popular MZmine platform for metabolomics into the domains of ion mobility separation and molecular networking, two state-of-the-art techniques that are essential for effective isolation and identification of diverse plant natural products. We will further develop and evaluate a novel bioinformatic approach based on genetic networking to associate plant natural products with their biosynthetic enzymes. We will demonstrate these technological advancements by mapping the chemodiversity of the Piperaceae plant family, widely recognized as a remarkable and underexplored reservoir of bioactive specialized metabolites.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - vedlejší obor
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - další vedlejší obor
10611 - Plant sciences, botany
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)CE - Biochemie
EB - Genetika a molekulární biologie
EF - Botanika
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2021
Ukončení řešení
31. 12. 2025
Poslední stav řešení
K - Končící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2024
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GM-R
Datum dodání záznamu
21. 2. 2025
Finance
Celkové uznané náklady
25 723 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
24 857 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
25 723 tis. Kč
Statní podpora
24 857 tis. Kč
96%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Biochemistry and molecular biology
Doba řešení
01. 01. 2021 - 31. 12. 2025