Development of DNA arrays and technology application for high throughtput gene identification, genotypisation for characterisation of genetic resources, breeding materials and breeders and consumers rights protection
Public support
Provider
Ministry of Agriculture
Programme
Using of natural sources (National programme of research)
Call for proposals
Využití přírodních zdrojů 1 (SMZE2004NTP3)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
5566/04 - 3020
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj a aplikace technologie DNA array pro vysoce kapacitní systém identifikace genů, genotypů a produktů pro potřeby jejich charakterizace a kontrolu trhu.
Annotation in Czech
Předkládaný projekt je zaměřen na vývoj a aplikaci technologie DNA polí (DNA arrays) pro charakterizaci genových zdrojů a šlechtitelských materiálů pšenice a možnost jejího využití pro kontrolní účely. V rámci řešení projektu budou vyhledávány odlišnostiv sekvencích alel u kontrastních materiálů od starých genových zdrojů přes nové výkonné odrůdy s pekařskou kvalitou. Budou využity techniky molekulární biologie - PCR, klonování, sekvencování a bioinformatiky - in silico vyhledávání a komparace sekvencí.Potřebné linie a odrůdy pšenic jsou k dispozici včetně řady charakteristik v genové bance VÚRV Praha. Budou testovány přístupy pro technologii DNA polí (DNA arrays), tak aby byl k dispozici vysoce kapacitní nástroj pro výše uvedené aplikace. Výstupem budou jak teoretické poznatky o struktuře genomu a jeho variabilitě u pšenice tak metodický podklad pro využití technologie DNA polí (DNA arrays) pro další rostlinné materiály. Jedná se o projekt strategický, který umožní i v ČR používat náročné techn
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Time and material procedure of the works agreed with the plan task and approved specifications for particular research years. From the point of view of practical application the appropriate results have been achieved.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2004
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 14, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-MZE-1G-U/04:3
Data delivery date
Nov 4, 2009
Finance
Total approved costs
10,475 thou. CZK
Public financial support
10,413 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
62 thou. CZK