Modification of histones in chromatin regions with increased and reduced expression
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promotion and support of young research workers (National programme of research)
Call for proposals
Podpora začínajících pracovníků výzkumu 2 (SMSM2004001K2)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Modifikace histonů v chromatinových oblastech se zvýšenou a sníženou expresí
Annotation in Czech
Předpokládá se, že různé modifikace histonů (histonový kód) korespondují s expresí nebo umlčením genů. Seskupení aktivních nebo umlčených genů v oblastech se zvýšenou expresí (Ridges) nebo sníženou (anti-Ridges)poskytuje dobrou příležitost k ověření hypotézy histonového kódu. Z tohoto pohledu jsou nejdůležitější úrovně metylací na pozicích H3K9 a H3K4 a acetylace. Tyto modifikace budou studovány pomocíprotilátek na fibroblastech a lymfocatech. Dále budou použity DNA próby pro jednu oblast Ridge a jednuanti-Ridge na daném lidském chromozómu. V projektu bude studována kolokalizace DNA prób s protilátkami odpovídajích histonovým modifikacíma bude určena jaderná a teritoriální topografie studovaných lokusů.
Scientific branches
R&D category
IF - RDI infrastructure
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Nuclear topography of ridge and anti-ridge regions of chromozome 11 and co-localization with histone modifications were studied in different human cell types. Differences in relative distances of the regions for each cell type were found.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-MSM-1K-U/04:2
Data delivery date
May 28, 2008
Finance
Total approved costs
448 thou. CZK
Public financial support
238 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
210 thou. CZK