NMR of European borrelia surface proteins
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D
Call for proposals
—
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
MSMT-15490/2019-2
Alternative language
Project name in Czech
NMR povrchových proteinů evropských borrelií
Annotation in Czech
Rozdíly ve strukturách a vazebních epitopech budou zkoumány NMR spektroskopií rekombinantních proteinů v roztoku doplněnou o další biochemické a biofyzikální metody. Značení pomocí isotopů a specifické mutace budou využity pro přirazení NMR signálů. Pokusy využívající tzv. „chemical shift perturbation (CSP) titration“ využijeme pro identifikaci vazebných epitopů. Sekundární struktura bude určena v první fázi projektu na základě chemických posunů, což umožní určit, zda jsou projekty správně sbaleny a sdílejí strukturní podobnost s proteiny studovanými v minulosti. NMR umožňuje určení vazebných míst v různých oblastech proteinů. Klíčové cíle projektu jsou: 1. Overexprese rekombinantních Dbps v bakteriálním systému (Escherichia coli) 2. Značení rekombinantních proteinů NMR aktivními stabilními isotopy 15N, 13C) obohacením kultivačního média 3. Multidimenzionální 3D NMR experimenty pro přiřezení rezonančních signálů 4. Určení sekundární struktury pro jednotlivé aminokyselinové zbytky 5. Určení 3D struktury proteinů 6. Studium interakce mezi Dbps a GAG molekulami pomocí NMR titrace
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was implemented within the framework of the MOBILITY Activity, whose main objective is to establish and deepen contacts with foreign research institutions. Therefore, the partial outputs of the project are not checked by the evaluation committee, but the correctness of the use of the allocated funds and the adequacy of their use are checked.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 3, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-8J-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
94 thou. CZK
Public financial support
94 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK