All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

NMR of European borrelia surface proteins

Public support

  • Provider

    Ministry of Education, Youth and Sports

  • Programme

    Promoting the mobility of researchers and workers in the framework of international cooperation in R&D

  • Call for proposals

  • Main participants

    Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    M2 - International cooperation

  • Contract ID

    MSMT-15490/2019-2

Alternative language

  • Project name in Czech

    NMR povrchových proteinů evropských borrelií

  • Annotation in Czech

    Rozdíly ve strukturách a vazebních epitopech budou zkoumány NMR spektroskopií rekombinantních proteinů v roztoku doplněnou o další biochemické a biofyzikální metody. Značení pomocí isotopů a specifické mutace budou využity pro přirazení NMR signálů. Pokusy využívající tzv. „chemical shift perturbation (CSP) titration“ využijeme pro identifikaci vazebných epitopů. Sekundární struktura bude určena v první fázi projektu na základě chemických posunů, což umožní určit, zda jsou projekty správně sbaleny a sdílejí strukturní podobnost s proteiny studovanými v minulosti. NMR umožňuje určení vazebných míst v různých oblastech proteinů. Klíčové cíle projektu jsou: 1. Overexprese rekombinantních Dbps v bakteriálním systému (Escherichia coli) 2. Značení rekombinantních proteinů NMR aktivními stabilními isotopy 15N, 13C) obohacením kultivačního média 3. Multidimenzionální 3D NMR experimenty pro přiřezení rezonančních signálů 4. Určení sekundární struktury pro jednotlivé aminokyselinové zbytky 5. Určení 3D struktury proteinů 6. Studium interakce mezi Dbps a GAG molekulami pomocí NMR titrace

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • OECD FORD - main branch

    10608 - Biochemistry and molecular biology

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The project was implemented within the framework of the MOBILITY Activity, whose main objective is to establish and deepen contacts with foreign research institutions. Therefore, the partial outputs of the project are not checked by the evaluation committee, but the correctness of the use of the allocated funds and the adequacy of their use are checked.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2020

  • Realization period - end

    Dec 31, 2022

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    May 3, 2022

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP23-MSM-8J-U

  • Data delivery date

    Jun 30, 2023

Finance

  • Total approved costs

    94 thou. CZK

  • Public financial support

    94 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK